配置一台兼具高性能CPU算第一性原理与GPU加速算MD的服务器

ggshining

我想配置一台兼具高性能CPU用于第一性原理计算和高性能GPU用于MD模拟的服务器，任务并不一定是同时进行的（CPU跑满时可不跑GPU，跑GPU时CPU也不一定用满，同时进行可能散热会比较难），预算暂时可不用考虑，请教各位专家是否可以实现？

此外，在论坛学习了一段时间配置搭配，自己想实现这个要求，暂时有几个问题不解（不一定对），想请大家帮忙看看：

1. GPU加速更吃CPU的单核性能，在这点上高性能CPU（如Intel 8380和8383C， 甚至AMD 9654）应该还不如桌面CPU（如i9 13900），此时用高性能CPU加速GPU性能是不是还比不上桌面CPU加速的效果？或者是不是有办法可以实现接近或更快的加速效果？

2. 如果问题1是可以实现的，请忽略问题2；如果问题1确实是事实，想请问下双路高性能CPU加速效果比桌面CPU差得多吗？大概能差多少？

3. 第一性原理计算（vasp和cp2k）和MD模拟（目前主要是lammps（reaxff和经典LJ力场），未来经典力场会考虑Gromacs）任务的需求基本55开，所以CPU性能也很看重，i9 13900、AMD 7950X虽然和8383C、8380跑分可能差不多，但是能搭成双路吗？实际计算软件性能应该很难和双路高性能CPU接近吧？


更新：目前想的方案是8383C+2块4090，一套预计应该6W左右能拿下（若不对可以直接喷），想问下和这套差不多的价格（最好7万以内）还有更好选择吗？

moritaichi

Entropy.S.I 发表于 2023-10-21 15:32
没问题。TITAN V功耗墙可以拉到300W，核心频率可以+160MHz，HBM频率可以+50MHz

感谢E佬

Entropy.S.I

moritaichi 发表于 2023-10-21 14:43
E佬求个咨询意见，我打算把以前的一台老机子加块二手的TITAN V玩玩，专用于跑跑lammps的ReaxFF，有空的话 ...

没问题。TITAN V功耗墙可以拉到300W，核心频率可以+160MHz，HBM频率可以+50MHz

moritaichi

Entropy.S.I 发表于 2023-10-19 12:38
注：

1. 没有P2P的多卡并行，涉及GPU和CPU内存空间之间的数据拷贝，所以还是尽可能把内存带宽拉满了 ...

E佬求个咨询意见，我打算把以前的一台老机子加块二手的TITAN V玩玩，专用于跑跑lammps的ReaxFF，有空的话看看有没有不合理的地方行不？
主板：微星B450M MORTAR MAX
CPU：R7 3800X（算力感觉还凑合？）
显卡：titan V换 radeon R9 fury（原卡的功耗275W超高，应该不存在电源问题）
内存：16g*2，ddr4， 3200

楚瑶

Entropy.S.I 发表于 2023-10-19 17:42
3000左右的V100 16G实际上是V100 12G，和TITAN V的规格完全相同。TITAN V能超频、拉功耗墙，自带散热，只 ...

非常感谢！

Entropy.S.I

楚瑶 发表于 2023-10-19 17:06
E佬，请问一下
1. 我看您之前还提到过二手V100，速度怎么样呢，相比于Titan V
2. 装这种普通工作站，怎 ...

3000左右的V100 16G实际上是V100 12G，和TITAN V的规格完全相同。TITAN V能超频、拉功耗墙，自带散热，只要2200多，比V100划算多了。

楚瑶

Entropy.S.I 发表于 2023-10-19 12:38
注：

1. 没有P2P的多卡并行，涉及GPU和CPU内存空间之间的数据拷贝，所以还是尽可能把内存带宽拉满了 ...

E佬，请问一下
1. 我看您之前还提到过二手V100，速度怎么样呢，相比于Titan V
2. 装这种普通工作站，怎么保证显卡的散热呢，我在咸鱼上看到这种小风扇，可以实现吗

moritaichi

Entropy.S.I 发表于 2023-10-19 12:38
注：

1. 没有P2P的多卡并行，涉及GPU和CPU内存空间之间的数据拷贝，所以还是尽可能把内存带宽拉满了 ...

牛的，感谢

Entropy.S.I

moritaichi 发表于 2023-10-19 11:24
E佬求教，如果是专用lammps跑ReaxFF，这三块TITTAN V 是插在同一张主板上吗，cpu选什么级别的不会拖后腿 ...

注：

1. 没有P2P的多卡并行，涉及GPU和CPU内存空间之间的数据拷贝，所以还是尽可能把内存带宽拉满了

2. TITAN V太便宜，所以追求太强的CPU单核性能并不划算，捡垃圾是最佳选择

moritaichi

Entropy.S.I 发表于 2023-9-19 19:46
我应该在论坛里提过很多次TITAN V。月初我帮课题组买了3块TITAN V专门用于跑ReaxFF，单价1950，性能是4090 ...

E佬求教，如果是专用lammps跑ReaxFF，这三块TITTAN V 是插在同一张主板上吗，cpu选什么级别的不会拖后腿，内存常规的32g够不够？

Entropy.S.I

我应该在论坛里提过很多次TITAN V。月初我帮课题组买了3块TITAN V专门用于跑ReaxFF，单价1950，性能是4090的1.5-2倍，性价比远远超过其他任何硬件，是当下跑ReaxFF的唯一最优选择。

4470kkk

reaxff gpu加速别用消费级显卡，reaxff支持的kokkos加速不支持单精度，看看显卡的双精度算力越高越好，推荐二手的P100和V100和泰坦V

Graphite

ggshining 发表于 2023-9-11 14:49
OK，如果用GPU加速的话，Intel加速包其实用处不大吧？（多体势几乎不用）
GPU加速效果和Intel加速包（不 ...

势函数支持GPU肯定用GPU，两张4090那纯算力少说是CPU的六七倍以上，intel包最快我只刷过2-3倍加速。

ggshining

Graphite 发表于 2023-9-11 14:25
都可以，AMD这几年性价比是好点，不过没法用LAMMPS的Intel加速包，这个包偶尔对一些不能GPU的多体势有不 ...

OK，如果用GPU加速的话，Intel加速包其实用处不大吧？（多体势几乎不用）
GPU加速效果和Intel加速包（不用GPU情况下）相比，计算intel加速包能加速的内容，应该还是GPU加速效果更好吧（瞎猜的，不对请指正），就8383C而言预计能快多少？

Graphite

ggshining 发表于 2023-9-11 14:18
明白了，谢谢大佬的解答。目前我暂定的方案是Intel8383C+2个4090或者AMD7763+2个4090，我看Etropy老师的b ...

都可以，AMD这几年性价比是好点，不过没法用LAMMPS的Intel加速包，这个包偶尔对一些不能GPU的多体势有不错效果。