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[Gaussian/gview] 使用Gaussian计算一个铵根离子与周围环绕五个水分子的LUMO HOMO基组与泛函选择问题

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本帖最后由 LHY1999LHY 于 2023-9-26 22:01 编辑

大家好,最近需要用Gaussian 09W C.01 9.0计算一个单独的水分子、一个铵根离子与周围环绕五个水分子,这两个状态下水的LUMO HOMO,查阅了一些文献和浏览了一些帖子后,决定使用M06-2X  def2-TZVP进行结构优化和单点能的计算 ,溶剂选择SMD的水,不知道选择的泛函和基组是否合理,如果不合理,有没有更合适的。当计算一个铵根离子与周围环绕五个水分子这个体系时,和计算单个分子一样,画出一个铵根和五个水,进行结构优化和计算前需要做构象搜索吗?谢谢大家

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-27 08:28:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-27 04:22
这个叫做团簇的构型搜索不叫构象搜索,构象搜索是对于分子内部结构而言的
优化、振动分析用B3LYP-D3(BJ)/6 ...

好的,谢谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-27 08:27:44 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-9-27 00:45
没问题
需要做构象搜索,但这个体系几乎肯定已经有人算过了,如果能查到之前文献构象搜索搜出来的最稳定构 ...

好的,谢谢您

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发表于 Post on 2023-9-27 04:22:06 | 只看该作者 Only view this author
这个叫做团簇的构型搜索不叫构象搜索,构象搜索是对于分子内部结构而言的
优化、振动分析用B3LYP-D3(BJ)/6-311G**足矣,用def2-TZVP太贵,用M06-2X则更容易出烦人的小虚频、难收敛,而且还比B3LYP-D3(BJ)更贵。此过程推荐用scrf关键词默认的IEFPCM
算能量时用你说的这个级别没问题
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发表于 Post on 2023-9-27 00:45:28 | 只看该作者 Only view this author
没问题
需要做构象搜索,但这个体系几乎肯定已经有人算过了,如果能查到之前文献构象搜索搜出来的最稳定构象,那可以跳过构象搜索,直接取文献构象做结构优化
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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