Gaussian16优化结构，l9999无法正常结束的问题

albinking · 发表于 Post on 2023-9-28 15:42:56

本帖最后由 albinking 于 2023-9-28 15:58 编辑

用Gaussian16 A.03版本做一个分子结构的优化（#p B3LYP/sddall opt freq），优化能正常结束，输出out文件末尾已显示“Normal termination of Gaussian 16 at Thu Sep 28 06:53:49 2023.” ，在/scratch/user/g16_tmp/里的临时文件G16在算完也正常删除了，但查看进程里却发现一直卡在l9999.exe。需要手动kill掉进程才能完全结束。
PID TTY STAT TIME COMMAND
24024 pts/1 Sl 170:21 /g16/l9999.exe 655360000 h2o.chk 1 /scratch/user/g16_tmp/Gau-24024.int 0

系统里有提示glibc检查到错误： *** glibc detected *** /g16/l9999.exe: munmap_chunk(): invalid pointer: 0x00002ae4e719c660 ***，不知道要怎么解决这个问题，大家有遇到过吗？

albinking · 发表于 Post on 2023-9-29 15:17:41

后来发现是glibc的问题，之前装新版本的glibc没装好，重新安装后问题已解决

sobereva · 发表于 Post on 2023-9-28 16:28:06

说明任务怎么运行/提交的

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[Gaussian/gview] Gaussian16优化结构，l9999无法正常结束的问题