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本帖最后由 skdmax 于 2023-11-6 22:54 编辑

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发表于 Post on 2023-11-4 09:37:48 | 只看该作者 Only view this author
sobEDA/sobEDAw给出的是片段间的总相互作用能,仅当片段间几乎只有氢键作用时才能视为是对氢键进行分析。
适当情况下,可以考虑对片段进行旋转,仅主要保留氢键,再用sobEDA/sobEDAw的结果进行讨论。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-3 14:39:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 skdmax 于 2023-11-3 14:40 编辑
wzkchem5 发表于 2023-11-3 14:22
这个简单,用orca的LED方法做分析就行了
按当前算出来的能量,自旋态不变化是合理的。但需要考虑可能DFT算 ...

谢谢您的回复,我这个体系还不小,我试试看看。现在用了SobEDAw做了分析,但是感觉不太好跟氢键直接对应。麻烦您帮忙看一下,谢谢!

#p b3lyp/def2tzvpp em=gd3bj ExtraLinks=L608 nosymm


*************************
***** Final results *****  SobEDA results
*************************

Total interaction energy:    -10.61 kcal/mol

Physical components of interaction energy derived by sobEDA:
Electrostatic (E_els):    -38.08 kcal/mol
Exchange (E_x):    -38.39 kcal/mol
Pauli repulsion (E_rep):    133.46 kcal/mol
Exchange-repulsion (E_xrep = E_x + E_rep):     95.07 kcal/mol
Orbital (E_orb):    -42.72 kcal/mol
DFT correlation (E_DFTc):    -13.27 kcal/mol
Dispersion correction (E_dc):    -11.61 kcal/mol
Coulomb correlation (E_c = E_DFTc + E_dc):    -24.88 kcal/mol

Please do not forget to cite original paper of Multiwfn program and sobEDA method in your work!

SobEDAw results
*************************
***** Final results ***** SobEDAw results
*************************

Total interaction energy:    -10.61 kcal/mol

Physical components of interaction energy derived by sobEDA:
Electrostatic (E_els):    -38.08 kcal/mol
Exchange (E_x):    -38.39 kcal/mol
Pauli repulsion (E_rep):    133.46 kcal/mol
Exchange-repulsion (E_xrep = E_x + E_rep):     95.07 kcal/mol
Orbital (E_orb):    -42.72 kcal/mol
DFT correlation (E_DFTc):    -13.27 kcal/mol
Dispersion correction (E_dc):    -11.61 kcal/mol
Coulomb correlation (E_c = E_DFTc + E_dc):    -24.88 kcal/mol

Variant of sobEDA for weak interaction (sobEDAw):
Note:   75.80% DFT correlation is combined with dispersion correction to yield a SAPT-like dispersion term
Electrostatic (E_els):    -38.08 kcal/mol
Exchange-repulsion (including scaled DFT correlation):     91.86 kcal/mol
Orbital (E_orb):    -42.72 kcal/mol
Dispersion (E_disp):    -21.67 kcal/mol

Please do not forget to cite original paper of Multiwfn program and sobEDA method in your work!
留给自己点琢磨的时间。

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发表于 Post on 2023-11-3 14:22:07 | 只看该作者 Only view this author
这个简单,用orca的LED方法做分析就行了
按当前算出来的能量,自旋态不变化是合理的。但需要考虑可能DFT算出来的能量差不靠谱。过渡金属体系,不同自旋态之间能量误差大于15kcal/mol都是很常见的。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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