模拟甲烷水合物固气体系水合物生成，到正式模拟一直报错

五月雨

各位老师好，我尝试做甲烷水合物的模拟，使用packmol生成了一个甲烷水合物体系，左侧是水合物固体，右侧是气水混合物：

                                   
使用ligpargen在线得到了甲烷的itp文件，水使用tip4p-ice，在opls-aa力场进行，能量最小化正常结束，但每次正式模拟时就出现以下报错：
Warning: Only triclinic boxes with the first vector parallel to the x-axis and the second vector in the xy-plane are supported.
         Box (3x3):
            Box[    0]={         nan,          nan,          nan}
            Box[    1]={         nan,          nan,          nan}
            Box[    2]={         nan,          nan,          nan}
         Can not fix pbc.


Fatal error:
Step 100: The total potential energy is nan, which is not finite. The LJ and electrostatic contributions to the energy are 0 and 0, respectively. A non-finite potential energy can be caused by overlapping interactions in bonded interactions or very large or Nan coordinate values. Usually this is caused by a badly- or non-equilibrated initial configuration, incorrect interactions or parameters in the topology.

我尝试在较低温度、低压力弛裕下、更换其他力场下产生的拓扑文件进行模拟，都是相同的报错，请问各位老师如何解决？

lxr123

目前我想建立一个含有CO2水合物晶体种子的，加速CO2水合物形成，但是不知道如何构建这个CO2水合物晶体种子pdb文件

lxr123

大佬，左侧的水合物固体的PDB文件是怎么建立的，用哪一个软件哈，还是下载的~~

sobereva

在确保拓扑文件无误的前提下，改用NVT看看什么情况