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[GROMACS] 求助:请问clayFF力场和Merze力场兼容吗?

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楼主
我想用gromacs模拟粘土和离子水溶液的混合体系,粘土我用了clayFF力场,请问离子用Merze力场能和clayFF兼容吗

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发表于 Post on 2023-11-19 01:23:11 | 只看该作者 Only view this author
Lisy 发表于 2023-11-18 13:47
谢谢卢老师,Lj项参数是指哪部分参数呢?另外如果我还想和Amber力场混用,我看到amber的库伦校正和LJ校正 ...

就是范德华作用,公式在AMBER和CLAYFF原文里都有
0.5和0.833那是1-4项乘的系数
离子和黏土之间没有共价键,不牵扯这个问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-18 13:47:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-11-18 12:37
那叫Merz
形式上可以兼容,注意LJ项参数的转化

谢谢卢老师,Lj项参数是指哪部分参数呢?另外如果我还想和Amber力场混用,我看到amber的库伦校正和LJ校正系数分别是0.5和0.833,而ClayFFl力场是1和1,这会不会有影响呢?

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发表于 Post on 2023-11-18 12:37:23 | 只看该作者 Only view this author
那叫Merz
形式上可以兼容,注意LJ项参数的转化
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