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[新手求助] 如何改变两个基团的折叠角度

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各位老师好,我想把这个分子结构折叠成不同的角度去测SOC的大小,但是用高斯试过了,没办法让两个苯环跟着一起改变角度达到折叠目的,我应该如何操作呢 y.gjf (1.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 0) 附件里,是我的分子结构

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发表于 Post on 2023-12-7 11:28:08 | 只看该作者 Only view this author
sxy66 发表于 2023-12-7 10:28
老师,高斯好像没办法实现这个分子的两个平面之间角度的改变,我用高斯即使冻结一些原子,但他的角度的改变 ...

看这示意图的样子就是两边以中间的两个原子作为旋转轴来旋转,根据旋转轴确定旋转矩阵不就好了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-7 10:28:33 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 sxy66 于 2023-12-7 10:29 编辑

老师,高斯好像没办法实现这个分子的两个平面之间角度的改变,我用高斯即使冻结一些原子,但他的角度的改变方向是附件里图一的样子,但我想让分子实现的是附件里图二的效果

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发表于 Post on 2023-11-22 17:38:57 | 只看该作者 Only view this author
用GIC方法(http://sobereva.com/404)。由立体几何知识不难确定具体需要定义什么样的GIC才能实现你的目的
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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