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[GROMACS] 进行pull操作时如何定义拉伸的方向

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如题,我的pull部分代码如附件所示,拉伸方式为恒力拉伸,体系为上下的石墨烯以及中间的甲烷部分,我固定了下方的石墨烯,让上方板子向下压,其中力的大小是经由单位转换器算出来的,体系温度为418K,施加在上表面的压强为30MPa,换算为力为1.779 kJ/(mol*nm),由gmx density得出的密度图显示中间平衡部分的密度为0.5几左右,与该温压条件下的密度之间差距很大,想请问下我的pull代码部分有没有问题?因为我是三个部分(上表面、CH4、下表面)分别控温的,不知道会不会对体系的pull过程产生影响?另外就是想请问下使用constant force时拉伸的方向是如何确定的,我将pull-coord1-vec由0 0 1改为0 0 -1,最后的拉伸方向还是朝着两边扩张的。希望各位老师抽空指点一下

pull.gro

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em.top

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CH4.itp

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pull2.mdp

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