预编译ssmp版本的CP2K算单点能一提交就终止任务

yaoyuan0711 · 发表于 Post on 2024-1-17 16:46:04

各位老师好！我用CP2K-ssmp版本在集群上算单个O2分子的能量，盒子30*30*30，一提交任务就终止了？

提示：Program received signal SIGABRT: Process abort signal.

mpirun noticed that process rank 5 with PID 0 on node gpu01 exited on signal 6 (Aborted).

这是什么原因？

chrinide · 发表于 Post on 2024-1-17 18:16:14

yaoyuan0711 发表于 2024-1-17 17:54
我加上了这个export OMP_NUM_THREADS=32还是不行？

你应该没有权限，在自己计算机/笔记本上先跑跑看，跑通了再提交服务器，有问题找服务器管理员

yaoyuan0711 · 发表于 Post on 2024-1-17 17:54:12

chrinide 发表于 2024-1-17 17:43
仔细阅读这个介绍 http://hpc.dlut.edu.cn/tjzy/tjzy.htm

我加上了这个export OMP_NUM_THREADS=32还是不行？

chrinide · 发表于 Post on 2024-1-17 17:43:56

仔细阅读这个介绍 http://hpc.dlut.edu.cn/tjzy/tjzy.htm

yaoyuan0711 · 发表于 Post on 2024-1-17 17:38:24

chrinide 发表于 2024-1-17 17:30
ssmp意味着不能用mpi并行

谢谢！请问怎么改成OpenMP并行，在提交任务的时候加什么命令？

chrinide · 发表于 Post on 2024-1-17 17:30:55

ssmp意味着不能用mpi并行

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[CP2K] 预编译ssmp版本的CP2K算单点能一提交就终止任务