关于lammps+plumed的数据后处理问题

lue611 · 发表于 Post on 2024-1-22 11:35:17

本帖最后由 lue611 于 2024-1-22 12:15 编辑

各位老师好，用plumed+lammps做on the fly probability enhanced sampling，用了两个cv，怎么可以得到二维的自由能面（FES）如下图。FES_from_Reweighting.py这个脚本好像只能得到一维的？
相关链接https://www.plumed.org/doc-v2.9/ ... terclass-22-03.html

ljh123 · 发表于 Post on 2025-9-25 23:10:22

本帖最后由 ljh123 于 2025-9-25 23:14 编辑

请问这个脚本能否用于元动力学的重加权？重加权的公式应该是一样的吧？
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仔细看了下教程，应该是可以的

zhitengcheer · 发表于 Post on 2025-9-2 17:59:12

可以得到2维度啊，在--cv cv1, cv2就行

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