关于金属卟啉轴向配体置换的过渡态搜索问题求助

imasen · 发表于 Post on 2024-2-1 18:54:22

我在寻找一个向铁卟啉轴向配体（一个组氨酸片段）和卟啉间插入一个H2O2的过程中的过渡态，在用gaussian联用xtb的方法下很快就找到如下图所示的过渡态，虚频振动方向和IRC结果都证实是我预想的过渡态。但当我使用这个结构作为初猜做DFT计算（方法为B3LYP-D3(BJ)/def2-SVP和TPSSh-D3(BJ)/def2-SVP，隐式溶剂为水）时，始终无法找到类似的结构，H2O2会逐渐远离，最终找到的都是一些与这个反应无关的虚频（跑了IRC也不正确）。这是否意味着这个反应在当前势能面下并不存在过渡态呢？

sobereva · 发表于 Post on 2024-2-2 02:16:45

基于GFN-xTB产生的结构当初猜，结合opt(recalc=5,notrust,maxstep=10)再试试。如果还收敛不到想要的过渡态，改成PBE0-D3(BJ)，基组用6-31G*结合SDD再试试。真空下也可以试试
如果确信了GFN-xTB下的过渡态在DFT下就是重现不出来，大概率就是虚假的过渡态。想验证没有过渡态，可以做柔性扫描之类

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[Gaussian/gview] 关于金属卟啉轴向配体置换的过渡态搜索问题求助