固体催化剂参与的有机反应是否可以用Gaussian进行计算

听风Z · 发表于 Post on 2024-2-27 19:16:04

各位老师好，我目前在用Gaussian做有机小分子机理的研究，体系无溶剂，是两个小分子底物的脱水缩合反应，两个底物在反应温度下均是液体。有两个固体催化剂参与反应，分别是卟啉timp和氯化胆碱ChCl。研究过程中用b3lyp/6-31g*几何优化，m062x/def2tzvp计算单点，二者均考虑了隐式溶剂模型。想通过比较自由能垒解释一些实验现象。我遇到的问题如下：
1.两个固体催化剂是当成周期性体系还是孤立体系计算，如果是周期性体系的话是否可以继续用Gaussian计算（本人目前只学会使用Gaussian）
2.体系是无溶剂反应，但两个底物均是液体，计算过程中采用隐式溶剂模型将两个反应物作为混合溶剂计算是否合理
（计算初学者，还请老师们解惑）

听风Z · 发表于 Post on 2024-2-28 19:36:16

wzkchem5 发表于 2024-2-27 19:23
对，需要把底物当作混合溶剂计算
这两个固体多少会溶解一点，需要先从实验上确定是没溶解的部分参与的催化 ...

好的，感谢老师解答

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-2-27 19:23:26

对，需要把底物当作混合溶剂计算
这两个固体多少会溶解一点，需要先从实验上确定是没溶解的部分参与的催化，还是溶解的部分参与的催化。如果只有溶解的部分参与催化，那就当溶液反应来算就行；否则很麻烦，因为你不知道固体暴露出来的是哪个晶面，表面有没有缺陷，等等，估计算不了

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