[GROMACS] 请问如何对粗粒化后的聚合物重复单元进行拼接？

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发表于 Post on 2024-3-5 11:30:42 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励

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本帖最后由 neoje 于 2024-4-22 16:46 编辑

本人想得到聚合物粗粒化后的itp和gro文件，目前采用的方法是使用martini3力场配合gromacs软件，目前通过别人开发的python代码cg_param能够直接得到重复单元粗粒化后的itp和gro文件，求助下各位前辈，如何对粗粒化后的itp或者gro文件进行拼接，来获得聚合物的粗粒化后的itp和gro文件呢？或者各位前辈有什么其他的实现聚合物粗粒化的方法吗？
谢谢~

monomerpbdt.gro

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monomerpbdt.itp

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