询问如何更改gromacs力场的调用目录

Allan_Zhang · 发表于 Post on 2024-3-25 14:18:50

我在下载力场的时候，gromacs软件自带力场部分是显示permission denied，所以我打算自己新建一个力场目录，在.bashrc中更改的为export GMXLIB=/lustre/home/gsklujlab2/zhanglin/gromacs/ff/top:$GMXLIB
但是当我输入gmx pdb2gmx 命令的时候显示如下图所示，显示文件是空的，这个情况我该怎么办？

lmch · 发表于 Post on 2024-3-26 05:15:03

你不如把力场文件移到工作目录
使用./xxx

或者../../xxx之类的

也可以echo $GMXLIB 看看出来的是啥

Allan_Zhang · 发表于 Post on 2024-3-25 14:19:36

在未修改GMXLIB=/lustre/home/gsklujlab2/zhanglin/gromacs/ff/top:$GMXLIB 这个时，就能正常调用

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