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[新手求助] 有关计算机理时是否考虑双键的E/Z构型的问题

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本帖最后由 @123 于 2024-3-31 17:00 编辑

各位老师好,我所计算的反应机理,反应物(左)和产物(右)结构如下,我通过计算解释了反应为何是1,4加成而不是其他加成方式,但是文章中提到生成的产物是E构型,但我所计算的是Z构型的,我是否应该重新计算一下E构型的?

由于我是又计算了加在C1,C2这种加成方式的过渡态由此得到的1,4加成是最优路径,但C1连接的是两个H,所以1,2加成的产物不涉及E/Z的问题,但是过渡态都是用Z构型算的,如果要加上E构型的,加在C1,C2上的这条路径是否可以不算E构型的,只补充1,4加成的E构型的就行?


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-31 19:53:42 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 @123 于 2024-3-31 20:15 编辑
wzkchem5 发表于 2024-3-31 18:22
对,应该加上E构型的。
1,2加成仍然涉及3-4双键的E/Z构型问题吧

3-4双键的E/Z问题我有验证过,基本上就相差1kcal/mol,那这样的话1,2加成是否可以不用把C2连接的交换位置再算一下

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发表于 Post on 2024-3-31 18:22:42 | 只看该作者 Only view this author
对,应该加上E构型的。
1,2加成仍然涉及3-4双键的E/Z构型问题吧
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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