计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1249|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 求助:lumo和homo分析,.log文件中NBO中一个unit变成了几个units

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

165

eV
积分
178

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 chenyp 于 2024-4-4 21:00 编辑

输入信息:# freq b3lyp/6-311++g(d,p) em=gd3 pop=(nbo,savenbo) scrf=(SMD,Solvent=Generic,Read)
name
-2 1
团簇xyz坐标(略)
solventname=DDS
RSOLV=4
EPS=3.6925
EpsInf=1.758
$nbo bndidx archive NRT BOAO $end

.log文件的Natural Bond Orbitals (Summary):
一个完整的C4H12O2Si,分成了C3H9OSi,CH3O

求助:这是从md中提取出来的团簇,所以没有做结构优化,我想让分析一个完整分子的lumo和homo,有没有什么命令能让一个分子不分解成几个部分


6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125174

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2024-4-5 17:26:17 | 只看该作者 Only view this author
chenyp 发表于 2024-4-5 11:34
非常感谢sob老师您的回答,我的计算的团簇是Li-C4H12OSi-FSI,写了一个脚本从.log文件中提取lumo和homo,但 ...

这是NBO分析的输出信息,跟HOMO、LUMO毫无联系
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

13

帖子

0

威望

165

eV
积分
178

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-5 11:34:51 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢sob老师您的回答,我的计算的团簇是Li-C4H12OSi-FSI,写了一个脚本从.log文件中提取lumo和homo,但是发现:Molecular unit  1  (C3H9Si), Molecular unit  2  (CH3O),感觉gaussian是把C4H12OSi分成了C3H9Si和CH3O两个部分,或许是结构不合理造成,而我需要的是C4H12OSi就是一个整体。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125174

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-4-5 02:34:25 | 只看该作者 Only view this author
考察HOMO、LUMO跟NBO分析没有丝毫联系。你写了savenbo就根本没法观看HOMO、LUMO。先搞清楚NBO是什么再说(相关资料:NBO分析资料汇总 http://bbs.keinsci.com/thread-102-1-1.html),没搞清楚基本原理不要乱写关键词

直接算个单点得到fch文件,按下文考察就完了
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 06:48 , Processed in 0.196574 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list