有机物在催化剂和溶剂水中的过渡态时如何确定溶剂水对反应的影响

科研好难 · 发表于 Post on 2024-4-17 21:58:07

各位老师好，我用CP2K的CI-NEB计算有机物在催化剂和溶剂水中的过渡态，我加入了隐式溶剂模型SCCS，得到稳定的吸附构型（图2），在进行搜索过渡态时遇到一个问题，即如图1所示为反应物，如果产物是C2-O4键断裂，C2-C3变成双键，这时有两种情况，一是变成双键后的C3上多余的H原子迁移到断裂的O4上；二C3上多余的H原子和水中的OH离子结合，而O4上的H来自于水中的H离子。第一种情况我知道怎么做，请问第二种情况该怎么做呢？

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-18 08:21:57

假设不是协同的，先计算H与OH-之间H转移过渡态，之后计算[H3O]+与O4的H转移过渡态

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[CP2K] 有机物在催化剂和溶剂水中的过渡态时如何确定溶剂水对反应的影响