计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 929|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 晶胞优化收敛后再通过MS设置真空层后opt不收敛

[复制链接 Copy URL]

6

帖子

0

威望

87

eV
积分
93

Level 2 能力者

       刚开始学使用cp2k这个软件,采用Fe的fcc结构替换两个Cr原子后进行晶胞优化结果收敛。目的是作为一个吸附的基底,所以再通过MS设置真空层再进行优化结果再也收敛不了,排除问题后去除吸附原子只留下优化后的基底后发现不收敛,实在理解不了这个情况,向各位大佬求解一下。
fefcc是进行晶胞优化的文件,fedzvp是设置真空层后的文件

fefcc-1.out

162.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

fefcc-1-1.restart

9.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

fedzvp.inp

8.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

fedzvp.inp

8.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

fefcc-1.inp

8.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2024-5-10 07:49:05 | 只看该作者 Only view this author
JianZ 发表于 2024-5-9 18:43
谢谢老师解答,确实出现了严重不收敛受力离谱的情况
我推测是我在第一步晶胞收敛时没有加磁性设置导致后 ...

非周期性方向上设k点毫无意义


根本不是报错。参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)的ppt:

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

6

帖子

0

威望

87

eV
积分
93

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-9 18:43:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-8 20:40
除了z方向不该设k点外,没有明显问题
注意监控优化过程中SCF收敛情况,严重没收敛可能导致受力离谱

谢谢老师解答,确实出现了严重不收敛受力离谱的情况
我推测是我在第一步晶胞收敛时没有加磁性设置导致后来加入真空层后不收敛,所以先进行加磁矩使得晶胞收敛再进行下一步。
对于您提出的k点设置是否可以理解为因为加入真空层后z方向太大,所以z方向上k点应该设置为1。
但是在晶胞优化时出现

*** WARNING in qs_scf_post_gpw.F:1848 :: Spin contamination estimate not ***
*** implemented for k-points.                                            ***

这个错误是否也和k点设置有关

fefcccr.inp

8.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

晶胞优化

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2024-5-8 20:40:14 | 只看该作者 Only view this author
JianZ 发表于 2024-5-7 14:54
sobereva老师根据您提到的设置磁矩重新设置inp文件,将fe和cr的初始磁矩设为3,通过smearing来使得迭代过 ...

除了z方向不该设k点外,没有明显问题
注意监控优化过程中SCF收敛情况,严重没收敛可能导致受力离谱
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

6

帖子

0

威望

87

eV
积分
93

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-7 14:54:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-24 07:05
显然得开smearing。当前当前都没设初猜磁矩这些,输入文件也太简单了

参考下文解决

sobereva老师根据您提到的设置磁矩重新设置inp文件,将fe和cr的初始磁矩设为3,通过smearing来使得迭代过程中每个原子的磁矩会慢慢趋于合理。但优化结果还是有很大问题,出现大量原子跑偏。想请教下您输入文件是否有其他问题。

fefcc001mag4.inp

7.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

fefcc001mag4-1.restart

9.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

6

帖子

0

威望

87

eV
积分
93

Level 2 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-7 10:03:14 | 只看该作者 Only view this author
还有一个用的GFN1-xtb方法收敛,但是结果Cs原子跑到我设的盒子边缘,正常应该是在基底中央上方的,是不是因为GFN1算小体系不准的原因。

fecsGX.inp

7.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

fecsGX-1.restart

8.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

楼主
发表于 Post on 2024-4-24 07:05:08 | 只看该作者 Only view this author
显然得开smearing。当前当前都没设初猜磁矩这些,输入文件也太简单了

参考下文解决
CP2K中遇到SCF难收敛时的解决方法
http://sobereva.com/665http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html

d族金属与真空的界面体系本身就是属于较难收敛的一类,表面原子的电子结构比体相更复杂。



评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
JianZ + 4 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 18:29 , Processed in 0.178598 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list