计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 499|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[NBO相关] 用Gaussian 生成的NBO plot文件里面没有NLMO轨道信息

[复制链接 Copy URL]

9

帖子

0

威望

3971

eV
积分
3980

Level 5 (御坂)

想用Multiwfn绘制NLMO轨道图,但用Gaussian 生成的NBO plot文件里面没有NLMO轨道信息 生成.39文件大小为0,
同样的方法试了一个小分子,又可以生成NLMO轨道信息的.39文件。
请教一下是什么原因?该怎么解决

输入文件:
%nprocshared=8
%chk=m062x-def2-svp-smd-Al-Al-trans-2PMe2-2nor-2NMes-nbo-plot.chk
%mem=4GB
#p m062x/def2svp  pop=nboread  scrf=(solvent=toluene,smd)

Title Card Required

0 1
P                 -1.57758400   -3.08586800    0.51149800
Al                -1.01090900   -0.73002700    1.18217800
N                 -2.70706900   -0.30282800    0.33646500
C                 -2.03088600   -4.27593900    1.83892700
C                 -0.50409000   -4.09847900   -0.57562200
C                 -3.09448200    1.05338900    0.17167700
C                 -3.53444200    1.79634900    1.28543600
C                 -3.87695200    3.14289000    1.11528500
H                 -4.21990900    3.71074900    1.98439700
C                 -3.80163000    3.77520200   -0.12667000
C                 -3.36347500    3.01876900   -1.21899600
H                 -3.29659900    3.49179800   -2.20383700
C                 -3.00238600    1.67473900   -1.09416600
P                  0.79169300    2.41718900   -0.43027200
Al                 0.85642500   -0.12090200   -0.44593800
N                  2.72672600    0.11051500   -0.10269300
C                  3.24368700    1.37446800   -0.04923600
C                  2.54141100    2.54661700   -0.17363100
C                  3.48780800    3.67529300    0.20631300
H                  3.20107300    4.67978000   -0.13158800
C                  3.74797100    3.55987300    1.73593500
H                  4.35903000    4.40133900    2.09593900
H                  2.80857800    3.55761100    2.30502400
C                  4.52299000    2.21752300    1.84633300
H                  4.00087900    1.46572000    2.45374400
H                  5.52138100    2.36367100    2.28236700
C                  4.65807000    1.75501300    0.36265800
H                  5.42659200    0.99169400    0.19362400
C                  4.81111500    3.11191100   -0.34614100
H                  5.69844700    3.66812900   -0.00643000
H                  4.81465500    3.03212000   -1.44208700
C                  0.35558100    3.38488700   -1.92639200
C                 -0.09871900    3.31102000    0.89832100
C                  3.61528700   -1.00052400   -0.16742400
C                  4.42975300   -1.18633800   -1.30520600
C                  5.29008400   -2.28428800   -1.35465000
H                  5.91582700   -2.42444100   -2.24077800
C                  5.35908000   -3.21525700   -0.31309300
C                  4.52294400   -3.02770300    0.78809200
H                  4.55110300   -3.74938300    1.60922500
C                  3.64938300   -1.93802400    0.88148100
C                 -3.40635400   -1.28850600   -0.28513300
C                 -3.04810700   -2.61502900   -0.35590600
C                 -4.24516100   -3.36922800   -0.91417900
H                 -4.03582500   -4.36276100   -1.33195500
C                 -5.36001600   -3.34657600    0.17064800
H                 -4.99885000   -3.74406500    1.12889400
H                 -6.22501000   -3.95212600   -0.13970000
C                 -5.72851000   -1.83891100    0.24460700
H                 -6.78550600   -1.67058100   -0.00612000
H                 -5.54898900   -1.39728100    1.23458800
C                 -4.81912700   -1.18923900   -0.84272100
H                 -5.13831400   -0.18906900   -1.15955600
C                 -4.78913900   -2.31132300   -1.89521200
H                 -5.79005100   -2.55249400   -2.28554800
H                 -4.09894000   -2.10768800   -2.72527200
H                 -1.12062200   -4.60049400    2.36492300
H                 -2.69106100   -3.77992700    2.56385400
H                 -2.53848400   -5.16094000    1.42730800
H                  0.44840200   -4.30902900   -0.06680900
H                 -0.99230800   -5.04910800   -0.83925600
H                 -0.29452300   -3.52264800   -1.48599000
H                  0.10793200    2.82733100    1.86260400
H                  0.20782600    4.36777400    0.93587100
H                 -1.18051200    3.25593400    0.70063800
H                  0.73874400    4.41310700   -1.84599400
H                  0.79348500    2.90638000   -2.81302800
H                 -0.73819600    3.41749400   -2.03292800
C                  4.34830700   -0.22151000   -2.45647800
H                  4.78558600    0.75698600   -2.20181300
H                  4.88203200   -0.61097600   -3.33317700
H                  3.29964700   -0.03402300   -2.73627700
C                  2.75035700   -1.78840600    2.07870200
H                  3.10613400   -2.40426800    2.91563500
H                  2.68157000   -0.74257600    2.40875000
H                  1.71907300   -2.10758600    1.84775000
C                  6.31700800   -4.37570700   -0.37926000
H                  6.36465300   -4.79694400   -1.39355000
H                  7.33764900   -4.06195000   -0.10820300
H                  6.02262800   -5.17748300    0.31143700
C                 -3.64244500    1.15348900    2.64162300
H                 -4.21674600    1.78770200    3.32999700
H                 -4.12876500    0.16955400    2.57693000
H                 -2.64712300    0.98617100    3.08573100
C                 -2.53250200    0.89673300   -2.29403800
H                 -1.69597200    0.22764000   -2.03799300
H                 -3.33514500    0.25626400   -2.69551300
H                 -2.21579700    1.57090400   -3.10210200
C                 -4.17178100    5.22529400   -0.29787600
H                 -3.31477200    5.81415100   -0.65917600
H                 -4.98080700    5.34496400   -1.03410700
H                 -4.50882900    5.66651700    0.64961700

$NBO plot file=Al-Al-trans-2PMe2-2nor-2NMes-nbo-plot $END                                            


小分子的可以
%chk=C2H4-nbo-plot.chk
%mem=200mb
%nproc=2
#p  m062x/def2svp  pop=nboread  scrf=(solvent=toluene,smd)

Title Card Required

0 1
C                  0.55788008   -0.29986053    0.00000000
H                  1.09104383   -1.22756545    0.00000000
H                 -0.51211992   -0.29986053    0.00000000
C                  1.23315439    0.87511677    0.00000000
H                  0.69999064    1.80282169    0.00000000
H                  2.30315439    0.87511677    0.00000000

$NBO plot file=C2H4-nbo-plot $END                                            





QQ截图20240424162420.png (128.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

QQ截图20240424162420.png

QQ截图20240424162447.png (123.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

QQ截图20240424162447.png

9

帖子

0

威望

3971

eV
积分
3980

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-25 08:36:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-24 18:59
看输出文件内容判断原因
NBO 3.1在某些情况下有bug,导致做不了NLMO。要么用更新的NBO,或者如果不是非用N ...

谢谢 Sob老师的回复

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-4-24 18:59:26 | 只看该作者 Only view this author
看输出文件内容判断原因
NBO 3.1在某些情况下有bug,导致做不了NLMO。要么用更新的NBO,或者如果不是非用NLMO不可,可以用Multiwfn产生定域化轨道讨论问题
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380http://bbs.keinsci.com/thread-6053-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 04:35 , Processed in 0.186599 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list