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[GROMACS] 如何构建掺杂金属的二氧化硅分子筛拓扑文件?

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参考:http://sobereva.com/soft/Sobtop/#ex9 中例9:产生二氧化硅晶体拓扑文件,只有Si和O两种原子类型,
假设我需要构建不同硅铝比的分子筛,
1. 那么铝是直接用UFF参数就可以吗?
2. 如果含有比例较大的铝,整体能兼容AMBER力场吗?
或者说有其他力场参数替代吗?



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发表于 Post on 2024-5-18 03:48:03 | 只看该作者 Only view this author
1 可以
2 当前问题和AMBER没直接关系,AMBER主要是描述生物分子,当前你也没提体系里有额外部分

含铝沸石是很常见的模拟体系,肯定能找到模拟的文章,里面也必然会提到专门的参数
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