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[CP2K] CP2K做NVT-AIMD时在几百步之后出现SCF无法收敛问题

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本帖最后由 Alset 于 2024-5-23 10:54 编辑

各位老师们好,

目前我在研究水分子于碳纳米管(碳原子固定)中的运动。在使用GROMACS得到平衡结构后,先用CP2K进行了几何优化(碳原子固定),作为后续NVT-AIMD模拟(碳原子固定)的初始结构。NVT-AIMD模拟一开始可以正常跑,但在~780步时出现SCF不收敛(最大步数128步)的问题,对.ener文件中的cons.qty作图,发现从这一步起能量发生巨大涨落,而势能和动能均看起来没有太大异常。

之前我使用了直径较小的碳纳米管进行同样的模拟时,并没有发生类似的问题,所以可能的原因以及解决方法是什么呢?


以下是一些参数设置,具体的还请查看附在文末的输入/输出文件。
输入文件为multiwfn产生;
PBE(D3)-TZV2P-MOLOPT-GTH;(抱歉,需要更正,使用的方法是revPBE(D3)-TZV2P-MOLOPT-GTH)
CUTOFF  300;
REL_CUTOFF  40;
PBC Z方向;

cnt-wt.rar

581.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 12

输入输出文件压缩包

cnt-wt-PBE-DZVP-CSVR.rar

1.63 MB, 下载次数 Times of downloads: 16

输入文件inp,输出文件.out,.xyz,.ener

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-24 17:21:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-24 04:52
把对角化改成OT

跑AIMD我一般都建议默认用OT

感谢您的建议!使用OT模拟可以顺利运行了!

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发表于 Post on 2024-5-24 04:52:48 | 只看该作者 Only view this author
Alset 发表于 2024-5-23 10:56
老师您好,我已经更新名为“cnt-wt-PBE-DZVP-CSVR.rar”的压缩包,里面包含了PBE(D3)-DZVP-MOLOPT-SR-GTH ...

把对角化改成OT

跑AIMD我一般都建议默认用OT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-23 10:56:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-23 04:39
前面说了,控温用CSVR。带了D3时必须写成PBE-D3
上传当前的输入文件、输出文件和轨迹文件压缩后也上传( ...

老师您好,我已经更新名为“cnt-wt-PBE-DZVP-CSVR.rar”的压缩包,里面包含了PBE(D3)-DZVP-MOLOPT-SR-GTH和CSVR控温的输入输出文件,麻烦您查看,谢谢!

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发表于 Post on 2024-5-23 04:39:22 | 只看该作者 Only view this author
Alset 发表于 2024-5-22 20:16
老师您好,我在采用了PBE+DZVP-MOLOPT-SR-GTH的参数后仍然出现AIMD中间某些步SCF不收敛的问题。
此外还 ...

前面说了,控温用CSVR。带了D3时必须写成PBE-D3
上传当前的输入文件、输出文件和轨迹文件压缩后也上传(超过5MB传网盘)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-22 20:16:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-21 15:18
TZV2P-MOLOPT-GTH跑动力学过于浪费,通常DZVP-MOLOPT-SR-GTH足矣,如果届时中途也遇上SCF难收敛,到时候再 ...

老师您好,我在采用了PBE+DZVP-MOLOPT-SR-GTH的参数后仍然出现AIMD中间某些步SCF不收敛的问题。
此外还测试了减小步长、改变CUTOFF为400、改变控温为NoseHoover,均无法解决问题,目前正尝试检查体系的压力。想请教您是否还有什么建议呢?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-21 15:45:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-21 15:18
TZV2P-MOLOPT-GTH跑动力学过于浪费,通常DZVP-MOLOPT-SR-GTH足矣,如果届时中途也遇上SCF难收敛,到时候再 ...

目前的基组泛函选择(revPBE(d3)+tzv2p-molopt-gth)是参考了J. Phys. Chem. Lett. 2017, 8, 1545−1551和Nature volume 609, pages512–516 (2022)。我会用PBE+DZVP-MOLOPT-SR-GTH测试的。

PSOLVER PERIODIC 这里是我改错了,我在模拟时测试了是PBC XYZ + POISSON PERIODIC XYZ, 和 PBC Z + POISSON PERIODIC XYZ, 都出现了我提到的问题。

非常感谢您的回复和仔细检查!

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发表于 Post on 2024-5-21 15:18:58 | 只看该作者 Only view this author
TZV2P-MOLOPT-GTH跑动力学过于浪费,通常DZVP-MOLOPT-SR-GTH足矣,如果届时中途也遇上SCF难收敛,到时候再说
强烈建议热浴用CSVR
PSOLVER PERIODIC不兼容Z方向周期性,应当用XYZ
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