求助：如何随机抽取分子振动模式

xdyjiay · 发表于 Post on 2024-6-21 14:19:41

想请问一下各位老师，假如有n个原子，有3n-6个振动模式，从这3n-6个振动模式中随机抽取一个振动模式，应该怎么抽取比较合适？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-6-24 16:31:57

xdyjiay 发表于 2024-6-24 08:56
想请问一下如果是根据高斯分布抽取振动模式的随机数，高斯分布的具体函数应该是什么样的啊？

xdyjiay · 发表于 Post on 2024-6-24 15:56:10

wzkchem5 发表于 2024-6-21 19:16
每个振动模式都要产生一个随机数。建议看一下多维高斯分布的抽样方法

想请问一下如果是根据高斯分布抽取振动模式的随机数，高斯分布的具体函数应该是什么样的啊？

Daniel_Arndt · 发表于 Post on 2024-6-22 10:43:03

Daniel Lambrecht在 https://doi.org/10.1021/jp110334w 这篇文章的Appendix部分写的内容可能对你有用。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-6-21 19:16:44

xdyjiay 发表于 2024-6-21 09:53
老师，随机抽取一个振动模式是要遵循高斯分布来抽，还是认为每个振动模式概率一样来抽？
还有一个问题， ...

每个振动模式都要产生一个随机数。建议看一下多维高斯分布的抽样方法

xdyjiay · 发表于 Post on 2024-6-21 16:53:39

wzkchem5 发表于 2024-6-21 15:14
随机抽取一个振动模式不难，产生一个1到3n-6之间的随机数就行了，bash、python乃至excel公式都能产生。
但 ...

老师，随机抽取一个振动模式是要遵循高斯分布来抽，还是认为每个振动模式概率一样来抽？
还有一个问题，确实是像您说的需要抽取各种振动模式的线性组合，根据文献的描述，我理解的是从1到3n-6抽出一个随机数乘以正则坐标，每个正则坐标都重复上面的操作，最后叠加产生一个位移矢量，不晓得我理解的正确吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-6-21 15:14:45

随机抽取一个振动模式不难，产生一个1到3n-6之间的随机数就行了，bash、python乃至excel公式都能产生。
但是很多时候需要的不是抽取一个振动模式，而是需要随机抽取各种振动模式的一个线性组合，此时需要写一个很短的脚本

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