求助，使用Gaussian16+Multiwfn脚本计算RESP电荷报错

YuniJ

前提：将聚合物和蛋白质的连接区域“抠“出来后通过sobtop产生基本拓扑信息以模拟聚合物定点修饰到蛋白
问题：然后使用Gaussian16+Multiwfn（3.8dev-Linux_noGUI）脚本计算RESP电荷提示：

%chk=gau.chk
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# B3LYP/def2SVP em=GD3BJ opt=loose scrf(solvent=water)
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1/7=-1,18=20,19=15,26=3,38=1/1,3;
2/9=110,12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=43,7=101,11=2,25=1,30=1,70=2201,71=1,72=1,74=-5,124=41/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5,53=1/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
7//1,2,3,16;
1/7=-1,18=20,19=15,26=3/3(2);
2/9=110/2;
99//99;
2/9=110/2;
3/5=43,7=101,11=2,25=1,30=1,70=2205,71=1,72=1,74=-5,124=41/1,2,3;
4/5=5,16=3,69=1/1;
5/5=2,38=5,53=1/2;
7//1,2,3,16;
1/7=-1,18=20,19=15,26=3/3(-5);
2/9=110/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,28=1/1;
99/9=1/99;
----
test
----
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1


Input Error Input Error Input Error Input Error Input Error Input Error

There are no atoms in this input structure !

Please fix the molecule specification section of your input and try again.

Input Error Input Error Input Error Input Error Input Error Input Error

请问应该如何解决这个问题，相关文件已上传
补充：考虑到将聚合物末端的C定点修饰到蛋白质的氮端上，移除了聚合物末端C连接的3个H原子

sobereva

结构一看就不合理，不仅有很多原子悬着，而且还有原子重叠了，显然计算毫无意义

结合基本化学常识判断结构没问题再去计算