求助使用交联脚本交联后交联度未达到设定值并没有交联成网

cgy · 发表于 Post on 2024-7-8 18:50:57

各位老师好，求助一下交联脚本进行均三苯甲酸（100个）和哌嗪（150个）进行交联时最终交联度只有33.7%，没有达到设定的56%，并且结构也没有连成网，就几个零散的交联结构，只有两个到三个分子交联起来的长度，没好友达到交联成网状结构的效果，请问各位老老师可以怎样解决，交联脚本与交联前的cell结构（AC盒子）和交联单体monomer（均三苯甲酸）和交联剂xlinker（哌嗪）和交联后的结构xlink-final的的结构文件附在附件里了。谢谢各位老师。

cgy · 发表于 Post on 2024-7-11 15:28:44

Starrymoon 发表于 2024-7-9 15:31
你试试改大一点交联的距离呢

您好，根据您的指导我增加了交联半径成功进行了交联，但是为什么交联之后AC盒子里出现了断键，请问您知道如何解决吗？

cgy · 发表于 Post on 2024-7-9 23:16:20

Starrymoon 发表于 2024-7-9 15:31
你试试改大一点交联的距离呢

好的，谢谢您，我尝试一下

Starrymoon · 发表于 Post on 2024-7-9 15:31:43

你试试改大一点交联的距离呢

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