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[量化理论] 计算激发态寿命误差问题

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看卢老师讲义中写的激发态寿命和实验值往往对应的不错,如果和实验值差异很大,有可能发生了显著的无辐射过程。
想请教一下大概差异到什么程度是差异比较大呢?我计算的一个分子,实验寿命值是3.34*10^8 ns,理论计算数值是1.5*10^8 ns, 实验值是理论值的两倍,不知道算不算差异大呢?

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发表于 Post on 2024-9-2 12:24:42 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-30 09:13
(1)会不会是构象没搜对、质子化状态没设对之类的问题
(2)不是。只要知道Eh是什么意思,就知道说明书 ...

谢谢老师的建议!我再去研究一下。

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发表于 Post on 2024-8-30 09:13:10 | 只看该作者 Only view this author
不会扣篮的后卫 发表于 2024-8-20 06:27
老师,您好
我按照您的建议,尝试加入TCutFreq参数,外加测试不同的泛函和基组,得到下图的数据。

(1)会不会是构象没搜对、质子化状态没设对之类的问题
(2)不是。只要知道Eh是什么意思,就知道说明书这里在说什么
(3)这个设置对计算结果没什么影响,最多是会略微节省计算量和内存消耗
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发表于 Post on 2024-8-20 13:27:13 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 不会扣篮的后卫 于 2024-8-20 13:32 编辑
wzkchem5 发表于 2024-8-13 16:12
如果做了稳定性分析,输出文件告诉你是稳定的,那就是稳定的,不存在“更稳定”一说。而且TightOpt并不能 ...

老师,您好
我按照您的建议,尝试加入TCutFreq参数,外加测试不同的泛函和基组,得到下图的数据。

感觉逐渐接近了实验值,但是还是差了两个量级。
(1)
请问老师可以再给点修改建议吗?
=======================================

我的想法是不是要考虑设置空轨道的数目在Orca输入文件里,

比如CP2K做TDDFT或者优化激发态计算,会有
  1. ADDED_MOS  -1  #-1代表所有空轨道数目,或者30代表30个空轨道
复制代码
参考Orca的手册里的空轨道参数设置,

(2)请问老师-3,3是指6个空轨道吗?
(3)参考了卢老师的Orca教学帖子,orca激发态输入文件介绍,感觉Orca的手册里的空轨道参数设置并不常用。
         请问老师,我#7楼计算里需要考虑空轨道吗?

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发表于 Post on 2024-8-14 13:34:51 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-13 16:12
如果做了稳定性分析,输出文件告诉你是稳定的,那就是稳定的,不存在“更稳定”一说。而且TightOpt并不能 ...

谢谢老师!

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发表于 Post on 2024-8-13 16:12:45 | 只看该作者 Only view this author
不会扣篮的后卫 发表于 2024-8-13 05:22
老师,您好
我按照您的分析,在#7楼的前4个输入文件里都加入了Tightscf,而且把opt变成Tightopt的情况下 ...

如果做了稳定性分析,输出文件告诉你是稳定的,那就是稳定的,不存在“更稳定”一说。而且TightOpt并不能增加得到稳定波函数的概率。
此外可以检查一下你的体系有没有特别低的频率,可以用TCutFreq去掉一些比较低的频率(例如小于100个波数的所有频率)试试
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发表于 Post on 2024-8-13 12:22:29 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-12 05:33
FC结构处振子强度不算太小,按理说HT项不应该比FC项大那么多。
我怀疑是DoHT计算出了问题,例如这个体系 ...

老师,您好
我按照您的分析,在#7楼的前4个输入文件里都加入了Tightscf,而且把opt变成Tightopt的情况下(想得到稳定SCF波函数),
最后得到的辐射速率为394 ns^-1(比之前848ns^-1的计算辐射速率下降了很多,但是和实验值1.35ns^-1的差距还是很大)。
请问老师如何得到更加稳定的SCF波函数或者有什么修改建议吗?

(附上新计算的相关数据)
Tightscf和Tightopt的情况下,
这个体系的基态和激发态的结构差距的RMSD的值为0.0366


蓝线结构为基态结构,粉线结构为第一激发态结构。


HT和FC结构处的振子强度


辐射速率

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发表于 Post on 2024-8-12 10:06:26 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-12 05:33
FC结构处振子强度不算太小,按理说HT项不应该比FC项大那么多。
我怀疑是DoHT计算出了问题,例如这个体系 ...

谢谢老师!

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发表于 Post on 2024-8-12 05:33:13 | 只看该作者 Only view this author
不会扣篮的后卫 发表于 2024-8-11 21:50
老师,您好
这个体系的基态和激发态的结构差距的RMSD的值为0.0367。

FC结构处振子强度不算太小,按理说HT项不应该比FC项大那么多。
我怀疑是DoHT计算出了问题,例如这个体系可能有不止一个稳定SCF波函数,在Herzberg-Teller效应涉及的有限差分计算里面,波函数在两个解之间跳来跳去,导致数值差分结果不对
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发表于 Post on 2024-8-12 04:50:11 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-8-11 17:23
基态和激发态的结构差别多大?
FC结构处的振子强度多大?

老师,您好
这个体系的基态和激发态的结构差距的RMSD的值为0.0367。


蓝线结构为基态结构,粉线结构为第一激发态结构。


关于您第二个问题,“FC结构处的振子强度多大?”
请问是指第五个计算(读取GS.hess和S1.hess的计算)的振子强度的输出结果吗?
如果是的话,振子强度如下图所示,


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发表于 Post on 2024-8-12 04:41:07 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-8-11 16:44
一方面可以加入溶剂模型+高精度方法,重新算一下绝热能差,然后在输入文件加“DELE xxxx”关键词来加入新 ...

谢谢老师!我再去研究一下。

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发表于 Post on 2024-8-11 17:23:53 | 只看该作者 Only view this author
不会扣篮的后卫 发表于 2024-8-11 05:54
老师,您好。
我按照您在帖子2楼的建议,打算做实验值和理论计算值的精确对比,
于是尝试了Orca的计算 ...

基态和激发态的结构差别多大?
FC结构处的振子强度多大?
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2024-8-11 16:44:15 | 只看该作者 Only view this author
不会扣篮的后卫 发表于 2024-8-11 12:54
老师,您好。
我按照您在帖子2楼的建议,打算做实验值和理论计算值的精确对比,
于是尝试了Orca的计算 ...

一方面可以加入溶剂模型+高精度方法,重新算一下绝热能差,然后在输入文件加“DELE xxxx”关键词来加入新算的更准确的绝热能差(hess不用重新算)

再一个可以考虑计算一下非辐射跃迁速率,因为实验值是由荧光寿命的倒数计算得到的,但如果非辐射部分占比很大的话,事实上测定的荧光辐射速率,是“实验测定寿命 = 1/(辐射速率+非辐射速率)”,如果非辐射速率很高,不可忽略时,实验测得的寿命会比用“1/辐射速率”算得的寿命要更短。

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发表于 Post on 2024-8-11 12:54:27 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-7-22 17:45
1/辐射寿命。非辐射速率按https://mattermodeling.stackexchange.com/questions/13227/assessing-excited ...

老师,您好。
我按照您在帖子2楼的建议,打算做实验值和理论计算值的精确对比,
于是尝试了Orca的计算来考虑Herzberg-Teller效应,然后想算出精确的辐射速率。


计算分为以下5个部分:
(1)优化基态结构
  1. ! B3LYP/G  6-311G**   opt  
  2. %maxcore     1000
  3. %pal nprocs   4 end
复制代码
(2)优化第一激发态结构
  1. ! B3LYP/G  6-311++G**   opt  
  2. %maxcore     1000
  3. %pal nprocs   4 end
  4. %tddft
  5.   IRoot 1

  6. end
复制代码
(3)通过优化后的基态结构,GS.xyz,计算得到GS.hess输出文件
  1. ! B3LYP/G  6-311G**   opt freq
  2. %maxcore  3500
  3. %pal nprocs   36 end

  4. * XYZFILE   0   1 GS.xyz
复制代码
(4)通过优化后的S1结构,S1.xyz,计算得到S1.hess输出文件
  1. ! B3LYP/G  6-311++G**   opt freq
  2. %maxcore  3500
  3. %pal nprocs   36 end
  4. %TDDFT
  5.    NROOTS  5
  6.    IROOT   1
  7. END
  8. * XYZFILE   0   1 S1.xyz
复制代码
(5) 辐射速率的计算
  1. ! B3LYP/G  6-311++G**   TIGHTSCF ESD(FLUOR)

  2. %maxcore 3500
  3. %pal nprocs 36 end
  4. %TDDFT  NROOTS 5
  5.         IROOT 1


  6. END       

  7. %ESD GSHESSIAN "GS.hess"
  8.      ESHESSIAN "S1.hess"
  9.      DOHT       TRUE
  10.      LINES      VOIGT
  11.      LINEW      75
  12.      INLINEW    200
  13. END
  14. * XYZFILE 0 1 GS.xyz
复制代码
最后得到的辐射速率为848 ns^-1,这个计算值和实验值1.35 ns^-1的差距很大。请问老师有什么修改的建议吗?

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发表于 Post on 2024-7-23 12:06:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-7-22 17:45
1/辐射寿命。非辐射速率按https://mattermodeling.stackexchange.com/questions/13227/assessing-excited ...

谢谢老师!

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