求助改性纤维素的建模及动力学模拟参数的获得

徐锡苇 · 发表于 Post on 2024-8-21 15:35:58

各位老师好，本人需要进行改性纤维素纳米晶的GROMACS下的分子动力学模拟。现在已经可以采用cellulose-builder搭建合适的纤维素纳米晶模型。现在需要对纤维素纳米晶模型进行表面改性，使部分纤维二糖单元中的羟基改为磺酸基。由于纤维素分子较大，是否有比较好的方法或软件进行批量修改？如何验证我改性的纤维素纳米晶结构是合理的（纳米晶要求是10X3X3nm)?磺酸基改性的纤维素纳米晶的力场选择什么比较好？如何获得获得其相关的GROMACS下的力场参数呢？

chunaizhanshi · 发表于 Post on yesterday 14:52

纤维素的改性建模解决了吗？编写rtp还没有学会，目前只会纤维素的建模

thest1ggy · 发表于 Post on 2025-11-14 20:48:59

徐锡苇发表于 2025-11-14 09:47
我是跟这个学的，https://blog.csdn.net/CocoCream/article/details/130149772?spm=1001.2014.3001.5501

收到，感谢

徐锡苇 · 发表于 Post on 2025-11-14 09:47:30

thest1ggy 发表于 2025-11-13 17:52
你好，我在网站上看到您用cellulose-builder搭建合适的纤维素纳米晶模型，请问可不可以教教我，有偿感谢。 ...

我是跟这个学的，https://blog.csdn.net/CocoCream/ ... 1001.2014.3001.5501

thest1ggy · 发表于 Post on 2025-11-13 17:52:30

你好，我在网站上看到您用cellulose-builder搭建合适的纤维素纳米晶模型，请问可不可以教教我，有偿感谢。邮箱：guanp1996@163.com。微信：19937859773

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[GROMACS] 求助改性纤维素的建模及动力学模拟参数的获得

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