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[ORCA] 铑配合物的催化反应的orca neb计算设置

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本帖最后由 littlepeach 于 2024-9-14 15:15 编辑

计算化学小白,我希望使用orca neb的方法计算铑配合物催化乙烯加氢这一反应的过渡态(不仅希望得到过渡态,同时希望用engrad参数得到受力数据),搜索帖子发现如果用gaussian计算最好使用“PBE0-D3(BJ) def2-SVP“,对于这一体系如果在orca中怎么样的计算设置可以接受呢?
下面是原始的反应物和产物的结构以及我用orca b3lyp/def2svp 结合python ase 3.22.1库跑neb得到的过渡态结构。 我对于过渡态结构计算了频率分析,设置也是b3lyp/def2svp ,得到的结果文件中唯一虚频是-39。如果只是想用orca的neb方法,更合理的计算设置应该是什么呢?



reactant.xyz (5.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 0) product.xyz (5.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 0) transition_state.xyz (5.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)



transition_state.log (485.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-21 18:10:41 | 只看该作者 Only view this author
我最近看到一些文献计算过渡金属配合物催化烯烃加氢的反应,用的b3lyp泛函,想问一下用pbe0的原因是什么以及有没有相关的支持文献说明pbe0要比b3lyp好呢。谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-15 10:48:59 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-9-15 08:44
泛函也用PBE0-D3(BJ)就行,但是因为ORCA支持(spin free)X2C,建议打开X2C,基组相应地用x2c-TZVPall,如 ...

好的谢谢老师

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发表于 Post on 2024-9-15 08:44:51 | 只看该作者 Only view this author
泛函也用PBE0-D3(BJ)就行,但是因为ORCA支持(spin free)X2C,建议打开X2C,基组相应地用x2c-TZVPall,如果算不动可以对非金属用x2c-SVPall
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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