求助，关于辣根过氧化物酶拓扑文件的生成

mbbbbb · 发表于 Post on 2024-9-20 10:12:50

本帖最后由 mbbbbb 于 2024-9-20 10:24 编辑

老师好，最近在做一个关于辣根过氧化物酶的模拟，初步设想是将酶中的铁卟啉单独提取出来，然后利用sobtop生产拓扑文件，把铁卟啉视为配体。但是酶中的铁卟啉与其中的氨基酸残基有一个配位键，请问这么做可行吗

sobereva · 发表于 Post on 2024-9-20 18:34:30

需要自己修改拓扑信息给相应的配位键加上bond相关的项

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[综合交流] 求助，关于辣根过氧化物酶拓扑文件的生成