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[综合交流] 求教三重激发态计算问题

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本帖最后由 wxy 于 2017-6-1 11:08 编辑

向论坛里的专家求教:

一共轭烯酮,C=C存在顺反异构,在室内自然光条件下Cis-Trans构型会很快互变,我的计算是想简单解释这种互变的可能机制。因此,做了下列计算:(1)通过C=C二面角扫描获得了基态(S0)势能面;(2)通过对S0势能面关键点用TD-DFT计算垂直激发能获得了单重激发态(S1)的势能面;做S1优化只能得到Cis-和Trans-S1,不能得到C=C键二面角扭转的结构;(3)对三重态,根据Sob在论坛上给的建议,以多重度为3,做Unrestricted DFT二面角扫描获得了一个三重态势能面(标为T0);(4)对T0势能面上的关键点以电荷-多重度为0-1用Restricted TD-DFT做三重态垂直激发能计算获得了另一个三重态势能面,标为T1。TD-DFT均计算第一激发态(即root=1)。计算获得的四个势能面如附图。我的问题是:
1、上述(4)对三重激发态激发能的计算方法是否正确?
2、二个三重态势能面差别很大,到底哪一个是三重激发态(即文献中通常所称的T1)的势能面?如果是附图标示的T0,那么T1应归属为哪个的势能面?
3、根据有关文献,我觉得这个体系Cis-Trans互变的可能路径应是S1经系间串跃(isc)成为三重态,三重态再经isc到S0而变为Cis-S0或Trans-S0。但如果这种互变是沿标示的T1势能面进行,需越过一个很高的能垒(约18Kcal/mol),似不合理。如果互变是沿T0的势能面进行,Cis和Trans间能垒很低,似合理,但T1与T0间需发生内转换(IC),这个IC是否必要?或由S1直接isc到T0?
4、如果互变经T0势能面进行,会产生另一个问题:这就是T0能量最低点与S0间的能差有点大,发生isc的可能性偏低,而T1的能量最低点与S0间的能差很小,发生isc的可能性更大,因此,有没有可能T0先经IC到达T1能量最低点、从这个T1点发生isc而到达S0?或T0不需IC到T1,而是直接isc到S0?

问题有点复杂,请老师、朋友赐教。先谢了!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-5 12:28:48 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wxy 于 2017-1-5 12:35 编辑
ggdh 发表于 2017-1-5 10:50
用的泛函基组是啥呢?

是B3LYP/def2-SVP. 在临近最高点减小扫描跨度,在84度和106度能收敛,在此之间不能收敛。

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发表于 Post on 2017-1-5 10:50:45 | 只看该作者 Only view this author
wxy 发表于 2017-1-4 23:21
已用TD对S1势能面做了柔性扫描,除相对于S0最低点的能量降低外,势能面形状未改变,S1-cis和S1-trans 仍 ...

用的泛函基组是啥呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-4 23:21:25 | 只看该作者 Only view this author
ggdh 发表于 2017-1-4 12:55
你为啥不直接用td在s1势能面上做柔性扫描,哦 不能收敛,就算不能收敛,最后的能量如果震荡幅度不大,仍 ...

已用TD对S1势能面做了柔性扫描,除相对于S0最低点的能量降低外,势能面形状未改变,S1-cis和S1-trans 仍为能量低点(能量分别降至74.9和75.9 Kcal/mol),仍在90度二面角附近不收敛,可收敛的能量最高点在75度,能量为95.1 Kcal/mol。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-4 14:10:32 | 只看该作者 Only view this author
ggdh 发表于 2017-1-4 12:55
你为啥不直接用td在s1势能面上做柔性扫描,哦 不能收敛,就算不能收敛,最后的能量如果震荡幅度不大,仍 ...

谢谢指点!我试试对S1做个扫描看。

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发表于 Post on 2017-1-4 12:55:56 | 只看该作者 Only view this author
wxy 发表于 2017-1-4 12:49
关于势能面,因为这个分子有个手性碳,双面角90度与-90度的能量有差别,事实上我做了0-360度扫描,给出的 ...

你为啥不直接用td在s1势能面上做柔性扫描,哦 不能收敛,就算不能收敛,最后的能量如果震荡幅度不大,仍然有参考价值

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-4 12:49:51 | 只看该作者 Only view this author
ggdh 发表于 2017-1-4 12:04
1.以S0最低点为参照得到T1势能面。就是最低三重态
0-3用DFT UB3LYP计算获得的也是最低三重态,这两个方 ...

关于势能面,因为这个分子有个手性碳,双面角90度与-90度的能量有差别,事实上我做了0-360度扫描,给出的图只是其中的一半(-45至约225度),另一半除能量略有差别外与给出的完全相同。
我对S1势能面也有疑惑,但做S1优化只能得到S1-cis或S1-trans,即使以二面角90和-90为初始结构优化仍会跑到S1-cis,如果固定双面角优化不能收敛。S1优化我以多重度1用RB3LYP优化,也用过UB3LYP,结果一样。

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发表于 Post on 2017-1-4 12:04:39 | 只看该作者 Only view this author
wxy 发表于 2017-1-4 11:31
谢谢赐教!
1. S1的势能面与S0的一致,我也觉得奇怪,不知道是否与这个体系有关(这个分子的结构如附图 ...

1.以S0最低点为参照得到T1势能面。就是最低三重态
0-3用DFT UB3LYP计算获得的也是最低三重态,这两个方法得到的是同一种态。
2.这个分子的LUMO轨道,双键那里肯定是个反键组合,而HOMO肯定是个成键组合。从成键到反键,旋转能垒一定会降低,而你的结果却没有降低。我估计你算的有问题。
3.你的势能面看起来很奇怪,横坐标应该是从0到90到180吧。S0的两个最小点对应的是0度和180度么?难道你是从-30度扫描到210度的?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-4 11:31:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wxy 于 2017-1-4 11:33 编辑
ggdh 发表于 2017-1-4 01:24
很奇怪:
1。S1和S0的势能面为啥一毛一样?你这个CC双键参与到S1的激发中了么?
2。T1和T0趋势应该相近啊 ...

谢谢赐教!
1. S1的势能面与S0的一致,我也觉得奇怪,不知道是否与这个体系有关(这个分子的结构如附图)。
2. 关于T1,见上我给小范范同学的回复。因T0是以电荷-多重度0-3用DFT UB3LYP计算获得,我理解这个T0相当于以三重态为基态的势能面,所以对T0关键点以以电荷-多重度0-1用TD-DFT RB3LYP做垂直激发能计算、以S0最低点为参照得到T1势能面。
S0和T0均用柔性扫描,但S0扫描临近最高点不能完成计算,是通过固定二面角优化完成的。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-1-4 11:02:51 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2017-1-3 17:40
之前我也想做这个Cis和trans的转换。正好看到你这个。
说一下我的理解,不一定对哈。
1:你的这个势能面 ...

谢谢范范同学不吝赐教。
1:S0-Cis和S0-Trans在扫描前都做了优化,但在扫描接近最高点时程序自动终止,所以高点附近的点是通过固定二面角优化完成的。
2:S1-Cis和S1-trans做了优化,但S1势能面来自S0相应点垂直激发能计算。还对S0最高点做单重激发态优化,得到的是S1-Cis(S1-cis的能量低于S1-trans),固定S0最高点二面角做单重激发态优化,计算不能完成。
3:T1势能面来自T0相应点垂直激发能计算。

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发表于 Post on 2017-1-4 01:24:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ggdh 于 2017-1-4 01:28 编辑

很奇怪:
1。S1和S0的势能面为啥一毛一样?你这个CC双键参与到S1的激发中了么?
2。T1和T0趋势应该相近啊。为啥差这么大。
另外你扫描S0和T0是柔性还是刚性扫描。?
P.S. 你的T0和T1 是用不同方法算的同一种态。

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发表于 Post on 2017-1-3 17:40:05 | 只看该作者 Only view this author
之前我也想做这个Cis和trans的转换。正好看到你这个。
说一下我的理解,不一定对哈。
1:你的这个势能面找发不对吧?我感觉是不是应该这样子:
优化Cis的结构得到S0-Cis。优化S0-trans的结构。同时两个结构之间做一个扫描(就是你这样的扫描),在差不多最高点这个结构,搜索过渡态。
这样S0的势能面就出来了。
2:然后,S1也是相同的办法,分别优化S1-Cis和S1-trans。然后扫描,找过渡态。
PS:我记得之前看过一个文献,他的S1就是做td这样近似表示。具体的我忘了。

3:关于你这个T1的计算,我感觉不太对吧?优化T1,采用03的方式可以。但是,我一般都是采用 01 triplet的方式,来和S1的方式是对应的。
你这里的T0应该就是T1,你的T1应该啥也不是。我感觉哈,不一定对、还望指点。

3:然后,你这个S1-T1或者T1-S0的势能面交叉,可以通过sob老师的MECP程序进行搜索。
http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=865
但是搜索S0-S1这样的交叉点好像是麻烦点,高斯文件好像不行,当时我看文章他们是casscf好像是,我在群里问过,比较麻烦。

个人理解,我也有很多不明白的地方,还望老师指点。
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

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