计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 137|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 关于过渡态搜索的计算能量的选择和振动频率分析的结构选择

[复制链接 Copy URL]

49

帖子

0

威望

164

eV
积分
213

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
老师好

我最近在做反应过渡态的搜索
反应为A+B=C
大致做法如下
1. 给出基元反应的初始态R1和终了态R12(A,B,C均分别作了结构优化)
2.利用DZVP+DFTD3(BJ)进行路径搜素(设置了12个replica)
3.得到了过渡态结构R6             此时根据路径文件得到的能量为E6

然后
在初始态R1和过渡态R6之间存在最低能量态R2 (两个分子有些许结构变化,记作A2和B2)  此时根据路径文件得到的能量为E2
在过渡态R6和终了态R12之间存在最低能量态R10  (C10  已经基本是产物的结构了)          此时根据路径文件得到的能量为E10   

然后
利用energy,
计算得到R6的能量E6'
分别计算得到R2中A2和B2的能量EA'和EB',E2'=EA'+EB'
计算得到R10的能量E10'

现在我要做台阶图,但是发现
E6-E2≠E6’-E2'
E10-E6≠E10’-E6'

问题一
所以请问老师,我应该选在哪一组作为台阶图的能量?
应该是1)过渡态搜索得到的能量 还是 2)根据energy模块计算得到的能量

问题二
在上述基础上,我要做温度影响分析,所以要做振动频率分析
我在做振动频率分析时,对于反应物有以下两种选择
1)直接对R2整体进行计算,得到G
2)分开对R2中的A和B进行计算,得到G后加和

谢谢老师

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 20:38 , Processed in 0.219790 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list