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[ORCA] ORCA几何优化无法正常进行

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老师们好!
我现在使用的是ORCA6.0版本,Windows系统,可以正常进行构象分析,但是在进行结构优化时,将之前得到的16个构象进行批量优化时报错。

由于无法在.inp文件中调用坐标文件,只能将分子坐标直接附在.inp文件中。当只添加一个构象的分子坐标时,可以正常运行,把16个分子坐标都加进去时就会报错(应该可以进行批量计算吧?是不是需要使用MPI进行并行计算?)。在使用MS-MPI进行并行运算时发现,当我的核心数设置为1,maxcore为1000MB时,将一个分子坐标附在.inp文件时可以正常运行,16个分子坐标都加进去时依然报错。

当我的核心数设置>1时,任何.inp文件运行时都会出错。(我的服务器时Windows系统的,应当配合MS-MPI使用,这个是正确的吧?)

希望各位老师可以给与帮助,十分感谢!!

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发表于 Post on 2024-10-25 07:51:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 aaq2800 于 2024-10-25 07:52 编辑

这个我就不知道啥原因了,我这么用感觉都正常

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-24 21:11:32 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2024-10-22 07:57
格式应当是这样的

!wB97X-D3 def2-SVP def2/J def2-SVP/C RIJCOSX opt tightSCF noautostart  miniprint ...

根据您给出的格式,对三个构象分子进行了连续的优化,但是运行时间长达9小时,单个运行每个构象分子大概半小时左右,请问可能是什么原因导致的这种差异呢?是orca不适用这种连续优化,还是我调用的核心数不匹配呢?附有输入文件,输出文件过大以图片形式上传,供参考。

diclo-8.inp

6.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

conf-1.inp

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发表于 Post on 2024-10-22 09:51:24 | 只看该作者 Only view this author
赵香兰 发表于 2024-10-22 02:43
感谢指导,现在单个分子坐标的已经可以运行了,正在尝试将多个分子坐标放在一个文件中运行。

不是所有软件都允许把多个分子坐标放在同一个文件里优化的
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-22 09:43:17 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-10-21 21:35
分子坐标格式不对,不能连着写多个"* xyz ... *"

感谢指导,现在单个分子坐标的已经可以运行了,正在尝试将多个分子坐标放在一个文件中运行。

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发表于 Post on 2024-10-22 07:57:28 | 只看该作者 Only view this author
格式应当是这样的

!wB97X-D3 def2-SVP def2/J def2-SVP/C RIJCOSX opt tightSCF noautostart  miniprint nopop
%id "1"
%maxcore  5000
%pal nprocs  4 end
%geom maxIter 400 end
* xyz 0 1
。。。。。
*

$new_job
!wB97X-D3 def2-SVP def2/J def2-SVP/C RIJCOSX opt tightSCF noautostart  miniprint nopop
%id "2"
%maxcore  5000
%pal nprocs  4 end
%geom maxIter 400 end
* xyz 0 1
。。。。。
*

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发表于 Post on 2024-10-21 21:35:43 | 只看该作者 Only view this author

分子坐标格式不对,不能连着写多个"* xyz ... *"
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-21 21:10:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-10-21 21:00
上传完整输入输出文件


diclo-3.inp

35.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

diclo-3.out

50.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2024-10-21 21:00:16 | 只看该作者 Only view this author
赵香兰 发表于 2024-10-21 13:55
老师,我试了一下,完整路径也不行

上传完整输入输出文件
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-21 20:55:37 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 赵香兰 于 2024-10-21 20:56 编辑
wzkchem5 发表于 2024-10-21 17:28
并行调用orca时必须给出orca的完整路径。手册讲如何并行调用orca的时候专门提了

C:\Users\Administrator\Pictures\屏幕截图 2024-10-21 204942.png

老师,我试了一下,完整路径也不行

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发表于 Post on 2024-10-21 17:28:20 | 只看该作者 Only view this author
并行调用orca时必须给出orca的完整路径。手册讲如何并行调用orca的时候专门提了
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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