使用Multiwfn进行aNCI分析遇到问题

lmtt · 发表于 Post on 2024-10-27 15:45:22

各位老师们，我在使用Multiwfn做aNCI分析图形化考察动态过程中的蛋白-配体间的相互作用时遇到以下几个问题想请教一下：
1.根据http://sobereva.com/591进行aNCI分析，进行第三步获得用于aNCI分析的xyz轨迹文件时，选择范围保存cluster.xyz得到是正常的（见图一），但是在选择范围保存cluster.pdb时发现不正常（见图二），明明都是选择配体附近4.0A，但是pdb文件中在范围外的原子也被选中了，请问这是什么原因呢？这种情况对后续分析有影响吗？
2.进行第四步计算aNCI格点数据时设置格点输入数之后Multiwfn闪退了，界面直接消失了，请问这是怎么回事？

sobereva · 发表于 Post on 2024-10-28 01:24:19

1 搞清楚各个残基的序号都是什么，不会无缘无故选上无关原子。多个残基有可能对应同一个残基号

2 下文搜闪退
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

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