求助：想构建48个单体随机聚合，成环，形成网状聚合物长链，不知道从何下手

cpa · 发表于 Post on 5 day ago

本帖最后由 cpa 于 2024-11-18 13:58 编辑

我主要有以下疑问：
①如何获取data文件，我已经通过gauss优化了结构单体，并通过packmol构建了40*40*40A，48个单体的盒子
②对于in文件如果定义了class2力场参数（参考文献用的是这个）data里是否还需要写相关力场参数信息
③对于in文件里fix成键相关判定我不知道该如何编写，小于8A成键，这里每个单体需要两个成键位点聚合N-C、N-C，其中一个单体会脱落两个N
④如何设置，直至聚合物无符合成键判断

cpa · 发表于 Post on 5 day ago

谢谢提醒

sobereva · 发表于 Post on 5 day ago

别自己手写【lammps】这种标签。这次给你改了，以后注意！
该写在帖子内容里的文字不要只出现在帖子标题里

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[Lammps] 求助：想构建48个单体随机聚合，成环，形成网状聚合物长链，不知道从何下手