计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10193|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求教:两条六肽之间的相互作用研究

[复制链接 Copy URL]

61

帖子

0

威望

630

eV
积分
691

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
如题:我想用gaussian计算两条六肽之间的相互作用,两条六肽之间是平行或者反平行的关系。我用M06-2X/6-31G*来优化结构和计算freq。想问一下还可以用gaussian计算哪些东西来研究两条链间的相互作用?(比如NBO分析之类的?)

61

帖子

0

威望

630

eV
积分
691

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-23 14:26:44 | 只看该作者 Only view this author
多谢sob:):lol

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120100

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2014-12-22 22:14:57 | 只看该作者 Only view this author
建议用6-31+G*,这是计算弱相互作用最低限度的基组。
如果计算能力不足,可用PM7在MOPAC2012下初步优化,进而在BLYP-D3下用orca优化,参考此文
大体系弱相互作用计算的解决之道
http://sobereva.com/214

弱相互作用分析方法见
Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览
http://sobereva.com/252

NBO对于弱相互作用分析没什么用,而且还有误导性。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
huanyizhen + 4

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-13 21:03 , Processed in 0.146321 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list