如何使用AIM拓扑分析定量判断位阻

cabbage

老师们好，再搜索相关信息后，了解到可以通过AIM定量分析判断位阻大小，sob老师说可以通过看临界点位置的sign(lambd2)rho的具体数值来判定。

我想请问通过电子密度拓扑分析已经得到各个临界值，想判断甲氧基在体系中位阻的大小是选用哪个临界点呢？上下各有一个甲氧基是选择109/53这两个点吗？
谢谢各位老师

cabbage

sobereva 发表于 2025-1-8 03:37
用Multiwfn的EDA-FF分析算那个互斥项可以尝试。但计算的时候要对未经优化、未自发扭转时的结构进行计算
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好的，谢谢老师我去看一下。

sobereva

cabbage 发表于 2025-1-7 09:12
好的老师，我是想判断引入取代基导致分子发生扭曲，这个扭转角受到引入取代基影响的定量关系，只有使用NB ...

用Multiwfn的EDA-FF分析算那个互斥项可以尝试。但计算的时候要对未经优化、未自发扭转时的结构进行计算

顺带一提，也专门有文章讨论了不同基团的位阻参数，可以看看和扭转角的相关性，参考北京科音中级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KBQC）这页ppt：

cabbage

sobereva 发表于 2025-1-7 02:16
没有公认的通过AIM拓扑分析定量判断位阻大小的方法。并且这个体系本来就没什么明显位阻

从轨道角度判断 ...

好的老师，我是想判断引入取代基导致分子发生扭曲，这个扭转角受到引入取代基影响的定量关系，只有使用NBO的steric分析可以实现吗，
使用“基于分子力场的能量分解分析”中的Repulsive，定义甲氧基和譬如113号旁边的H，计算两个片段直接的互斥项，这样是合理的吗？

sobereva

没有公认的通过AIM拓扑分析定量判断位阻大小的方法。并且这个体系本来就没什么明显位阻

从轨道角度判断倒是可以试图做NBO里的steric分析，考察氧的LP轨道和C-H的BD轨道的Pauli互斥，量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班（http://www.keinsci.com/WFN）里面“其它NBO分析方法”的部分里有原理和用法的详细说明。