[GROMACS] 一个到达小分子RMSD阈值自动终止Gromacs模拟的小脚本

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James-Li7571

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发表于 Post on 2025-1-31 11:33:09 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励

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本帖最后由 James-Li7571 于 2025-2-1 17:54 编辑

其中，默认tpr名为md.tpr,输出名为md.xtc,RMSD阈值为0.9，检测间隔为20s，RMSD参考组为4，计算组为13，如不是可自行在脚本中修改
准备好md.tpr文件后直接使用bash运行脚本即可

https://doi.org/10.5281/zenodo.14768647

本主题由 sobereva 于 2025-2-1 16:45 设置高亮