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[Multiwfn使用咨询] 求助使用multiwfn和vmd作图的一些问题

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本帖最后由 yangxuesong 于 2025-3-23 10:34 编辑

各位老师 大家好 我是一个新手,最近在学习multiwfn和vmd作图 但是遇到1个问题  需要大家帮忙指导一些  谢谢大家
我跟着sobe老师的教程对分子之间的相互作用使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用,我跟着教程得到了正常的multiwfn的Hirshfeld surface图,
后续,我就安装教程去vmd作图,但是做出来的图是黑色的 ,不知道为什么,这些分子之间肯定有相互作用力,大概是2.8 A左右  是C-Hπ相互作用。我用的vmd版本是1.93版本,2个版本都试了,都不行,为了排除是软件的问题 ,我试了另外一个sobe老师之前教程里面的一个分子,这个分子确实可以正常显示,说明应该不是软件问题。所以现在想咨询一下,怎么将他弄成正常的颜色呀
这是我hirsh_rho.vmd的文本    我看了教程里面是只能说,蓝 ,白 ,红,但是这个黑色不知道为什么会出现。  谢谢大家了
color Display Background white
axes location Off
display depthcue off
display rendermode GLSL
color scale method BWR
#light 3 on

material change specular Translucent 0.200000
material change diffuse Translucent 0.5
material change Opacity Translucent 0.85
set colorhigh 0.015

mol new surf.cub
mol addfile mapfunc.cub
mol modstyle 0 top Licorice 0.200000 17.000000 17.000000
mol addrep top
mol modstyle 1 top Isosurface 0.5 0 0 0 1 1
mol modmaterial 1 top Translucent
mol modcolor 1 top Volume 1
mol scaleminmax top 1 0.0 $colorhigh

图片1.png (387.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 28)

图片1.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-23 21:26:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-23 13:56
注意正确拼写sobereva

用本论坛的VMD 1.9.3 64bit版再试。还不行就用tachyon渲染看是否能正常得到结果。 ...

谢谢sobereva老师 我试试

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2#
发表于 Post on 2025-3-23 13:56:51 | 只看该作者 Only view this author
注意正确拼写sobereva

用本论坛的VMD 1.9.3 64bit版再试。还不行就用tachyon渲染看是否能正常得到结果。还不行就换机子
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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