计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 342|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 求助CP2K算出的能量并不与JARVIS数据集中相同的问题

[复制链接 Copy URL]

16

帖子

0

威望

81

eV
积分
97

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
#
尊敬的各位老师:

您好

发表这个贴子的目的是想询问一下为什么CP2K算出的总能量并不与数据集中给出的总能量相同,我想询问我的计算方法是否有误。

在JARVIS数据集中,JVASP-582的总能量是-4.17391eV/atom,一共是12个原子,也就是-49eV左右,运用的方法是optb88vdw。

但是用cp2k算出来的结果是-304.080417195797396 Hartree。

具体的晶体结构文件,cp2k的输入文件,cp2k的输出文件如下所示。

烦请各位老师指导

此致

敬礼


JVASP-582.cif

1.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

JVASP-582band.inp

8.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

JVASP-1.out

30.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

72

帖子

0

威望

2091

eV
积分
2163

Level 5 (御坂)

10#
发表于 Post on 2025-12-28 20:15:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chenzhe 于 2025-12-28 20:18 编辑
yangzexi19 发表于 2025-12-26 09:28
那我想请教一下,要怎样才能计算出JARVIS数据集中的结果,我看他描述也是通过VASP计算的,所以这个是我的 ...

当然可以。但是计算化学里面最基本的概念就是能量参考点的问题,本来只有相对能量才有意义,这种绝对能量值就没啥用,根本不存在说复现不复现的问题的。你要愿意你开发一个程序把C原子能量定成1百万 Ha,也丝毫不影响结果。你只能看相对差值。没什么好困惑的,因为这个数值本来就是任意定的。非得要对比,你得把两者能量参考点平移了。比如你用vasp算出晶胞能量为100,cp2k是1000,你把cp2k的能量同减去900就是了。

16

帖子

0

威望

81

eV
积分
97

Level 2 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-26 09:28:14 | 只看该作者 Only view this author
chenzhe 发表于 2025-12-26 09:09
Sob老师都说了,没有对比性,因为能量参考零点本来就是程序任意选择的。你只能对比相对能量,比如构型A- ...

那我想请教一下,要怎样才能计算出JARVIS数据集中的结果,我看他描述也是通过VASP计算的,所以这个是我的困惑。是不是cp2k就无法复现出数据集的结果

72

帖子

0

威望

2091

eV
积分
2163

Level 5 (御坂)

8#
发表于 Post on 2025-12-26 09:09:52 | 只看该作者 Only view this author
yangzexi19 发表于 2025-12-26 08:54
没有解决,我用VASP计算的平均原子能量与数据集中的也不相同。。。。

Sob老师都说了,没有对比性,因为能量参考零点本来就是程序任意选择的。你只能对比相对能量,比如构型A-构型B的能量差

16

帖子

0

威望

81

eV
积分
97

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-26 08:54:45 | 只看该作者 Only view this author
myDFT0718 发表于 2025-11-18 10:00
楼主解决这个问题了吗?如果只是除以原子数量,得到的平均原子能量和vasp等软件差异巨大。这是因为CP2K算的 ...

没有解决,我用VASP计算的平均原子能量与数据集中的也不相同。。。。

1

帖子

0

威望

11

eV
积分
12

Level 1 能力者

6#
发表于 Post on 2025-11-18 10:00:06 | 只看该作者 Only view this author
楼主解决这个问题了吗?如果只是除以原子数量,得到的平均原子能量和vasp等软件差异巨大。这是因为CP2K算的是绝对能量,vasp是相对能量。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124668

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2025-4-25 12:33:43 | 只看该作者 Only view this author
yangzexi19 发表于 2025-4-25 12:09
谢谢您的回复,但是我刚入门这个领域,不太懂晶胞的能量怎么计算,我仔细搜了一些帖子,也没有找到,能麻 ...

北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)、http://bbs.keinsci.com/thread-53062-1-1.html

正经学一遍自然就会了。基本的计算知识绝对不是靠三言两语在论坛上能说明白的,更何况CP2K不是傻瓜式程序,正确使用要学习的知识极多。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

16

帖子

0

威望

81

eV
积分
97

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-25 12:09:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-25 11:43
算晶胞得到的能量除以原子数目

谢谢您的回复,但是我刚入门这个领域,不太懂晶胞的能量怎么计算,我仔细搜了一些帖子,也没有找到,能麻烦您告知一下怎么计算晶胞的能量吗,谢谢卢老师。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124668

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2025-4-25 11:43:18 | 只看该作者 Only view this author
yangzexi19 发表于 2025-4-25 10:24
卢老师我想请问,平均每原子的能量应该是怎么算的,cp2k可以计算吗?可以计算的话应该怎么操作,谢谢老 ...

算晶胞得到的能量除以原子数目
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

16

帖子

0

威望

81

eV
积分
97

Level 2 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-25 10:24:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-23 15:06
不同级别算的绝对能量完全没有可比性,赝势的核尺寸不同的情况下绝对能量的数量级都往往不同。此外,晶胞的 ...


卢老师我想请问,平均每原子的能量应该是怎么算的,cp2k可以计算吗?可以计算的话应该怎么操作,谢谢老师回复!

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124668

管理员

公社社长

楼主
发表于 Post on 2025-4-23 15:06:14 | 只看该作者 Only view this author
不同级别算的绝对能量完全没有可比性,赝势的核尺寸不同的情况下绝对能量的数量级都往往不同。此外,晶胞的能量和平均每原子的能量也是两码事
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-23 23:35 , Processed in 0.193184 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list