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[新手求助] 吸附建模中被吸附物质位置的问题

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为什么DFT计算吸附结合能看到,有些文献是类似图片这样已经体现出被吸附物质与吸附剂的结合方式从而计算结合能,有些只是放在潜在的吸附位点呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-23 19:43:47 | 只看该作者 Only view this author
gyp 发表于 2025-4-23 19:29
连接只是显示问题,作图人没手动更改连接方式而已。http://sobereva.com/414

好的明白了 非常感谢老师!

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发表于 Post on 2025-4-23 19:29:20 | 只看该作者 Only view this author
哈哈哈哈哈aaa 发表于 2025-4-23 19:19
sob老师,就是有些画法会体现出吸附质和吸附剂具体结合方式(有具体的官能团连接)从而计算结合能,有些 ...

连接只是显示问题,作图人没手动更改连接方式而已。http://sobereva.com/414

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-23 19:19:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-23 19:11
“潜在的吸附位点”指代不明
倘若能估计出应该吸附在哪,当然先要优化出实际的(通常是自由能最低的)吸附 ...

sob老师,就是有些画法会体现出吸附质和吸附剂具体结合方式(有具体的官能团连接)从而计算结合能,有些是吸附质和吸附剂摆放的具有一定距离(没有共价键连接),我看有些文献吸附质和吸附剂是一样的,但是有些采用的是前者方法,有些是后者的方法,那我应该采用哪种方式呢?

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发表于 Post on 2025-4-23 19:11:45 | 只看该作者 Only view this author
“潜在的吸附位点”指代不明
倘若能估计出应该吸附在哪,当然先要优化出实际的(通常是自由能最低的)吸附后的结构
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