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[Gaussian/gview] 利用虚原子定位进行势能面扫描

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本帖最后由 1215052330 于 2017-3-15 22:11 编辑

请问我的.gjf文件设置的32号原子与25号虚原子进行它们之间距离的硬扫,为什么.log文件变成32号原子与26号原子(实原子)之间的距离扫描?还有为什么有时虚原子会消失?(test10.gjf+test10.log)
请各位大咖指导下,谢谢啦。

test10.log

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test10.gjf

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-17 17:21:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-16 23:28
让蒽恰处在XY平面上,对其z坐标进行扫描(所有蒽的原子z坐标用相同变量表示,让这个变量不断改变)

好的,谢谢老师。

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发表于 Post on 2017-3-16 23:28:42 | 只看该作者 Only view this author
1215052330 发表于 2017-3-16 08:57
老师,我想让整个连二苯向上移动,但是现在只有一个苯环在朝上动,请问该怎么设置才能使整个连二苯整体朝 ...

让蒽恰处在XY平面上,对其z坐标进行扫描(所有蒽的原子z坐标用相同变量表示,让这个变量不断改变)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-16 08:57:31 | 只看该作者 Only view this author
1215052330 发表于 2017-3-16 08:42
明白了,谢谢老师。

老师,我想让整个连二苯向上移动,但是现在只有一个苯环在朝上动,请问该怎么设置才能使整个连二苯整体朝上动?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-16 08:42:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-15 23:55
你当前的扫描不是很正常么,用gview看输出文件,测量X25-C32距离,就是按照你要求的变化的

明白了,谢谢老师。

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发表于 Post on 2017-3-15 23:55:34 | 只看该作者 Only view this author
你当前的扫描不是很正常么,用gview看输出文件,测量X25-C32距离,就是按照你要求的变化的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-15 22:12:25 | 只看该作者 Only view this author
ggdh 发表于 2017-3-15 22:09
你的附件没有出现啊

已上传,不好意思

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发表于 Post on 2017-3-15 22:09:24 | 只看该作者 Only view this author
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