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[Lammps] 研究3D MXene在水中剥离为2D MXene的疑问

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各位老师好,我想研究3D MXene在摇晃过程中剥离为2D MXene。在这个过程水分子冲刷3D MXene表面,导致2D MXene被剥离,另一方面,剥离过程由于应力集中(2D MXene与3D MXene连接处),因此2D MXene 在脱层过程中可能会断裂。因为是新手,所以目前有几个疑问想请教一下:
1.我应该先把水分子,MXene能量最小化以后再放到一个盒子里面再进行一次能量最小化还是直接创建一个水分子和MXene混合的盒子直接能量最小化
2.因为模拟的MXene尺寸只有纳米级别,这个尺寸的应力集中可能导致MXene 不会断裂,我该怎么解决,
3.3D MXene片层的间距直接可以使用文献上的吗,还是需要自己优化,LAMMPS怎么进行优化呢

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