甜点型GPU用于单细胞等生物信息分析机器学习推荐哪一款？

llity · 发表于 Post on 2025-5-20 21:19:32

本帖最后由 llity 于 2025-5-21 21:12 编辑

想自己组一套生物信息分析的服务器，预算有限。CPU计划使用至强六代 6787P 双路，然后就是GPU不太了解，原则是够用就行小几万内，主要就是单细胞和机器学习。

配置	数量	单价
CPU：6787P	2	2万以内
显卡：A6000？	1	12000元
机箱：Dell R770	1	10000左右
内存条：DDR5 64GB	12

谢谢

在生物信息学特别是单细胞数据分析中，GPU 的选择主要取决于你要运行的任务类型，比如：

使用 Scanpy、Seurat 等工具进行大规模单细胞数据预处理与聚类；
利用 深度学习模型（如 scVI、scANVI、CellBender、autoencoders）；
做 图神经网络（如 GraphSAGE, GAT） 或 变分自编码器（VAE）；
应用 机器学习推荐模型（比如在药物反应预测、细胞命运预测中）。

SilverYang · 发表于 Post on 2025-6-12 15:56:19

不要什么都问AI，至少单细胞的工作流程中绝大多数过程根本不需要GPU参与。如果你分析流程以R为主完全不需要考虑加GPU，如果以Python为主的分析流程除了scanPy有简单的非官方的GPU支持外，所有主流的单细胞分析工具都不支持GPU加速。有这个钱不如提高在存储和内存上。另外基于R的工作流程高度依赖单核性能，强烈不推荐使用任何单核主频过低的CPU。

夜航星 · 发表于 Post on 2025-6-10 14:43:44

显卡还是建议能上4090，5090就上，CPU可以缩水啊，要那么好的CPU干嘛，现在很多的机器学习程序都是要用CUDA的，即使用那么好的CPU也基本上对处理数据的上限没有足够帮助

llity · 发表于 Post on 2025-5-30 18:41:16

sss668800 发表于 2025-5-30 10:40
你说的这种渠道我也有，比淘宝贵10%以内，淘宝现在6787w最低2w7，我这里估计就是3w出头的价格。明年2w以 ...

值得一等，现在三代也是当打之年。买的时候再更新帖子

sss668800 · 发表于 Post on 2025-5-30 10:40:56

llity 发表于 2025-5-28 19:29
问了确实是3W，但不告诉你什么渠道。如果按核心算，这个CPU明年在1.5W左右还是能接受的

你说的这种渠道我也有，比淘宝贵10%以内，淘宝现在6787w最低2w7，我这里估计就是3w出头的价格。明年2w以内是有希望的。

但是我是这么想的，明年这时候就会流出来像今年8581c这种OEM版本，价格8000块钱就够了。既然你已经选择了这种店铺保修的渠道，干脆直接等OEM版本呗。性能更强，而且更便宜。

sss668800 · 发表于 Post on 2025-5-30 10:38:21

llity 发表于 2025-5-28 19:29
问了确实是3W，但不告诉你什么渠道。如果按核心算，这个CPU明年在1.5W左右还是能接受的

那就和淘宝那种一样的拆机CPU，店保的，出了问题找不到人就很麻烦。

dell或者其他厂家的官方直接升级还得要8万。

llity · 发表于 Post on 2025-5-28 19:29:52

本帖最后由 llity 于 2025-5-28 19:31 编辑

sss668800 发表于 2025-5-28 16:57
我看淘宝就一家3万的正式版，但是不知道靠不靠谱，其他都是7万以上。

淘宝很多店都是引流的，你得要按 ...

问了确实是3W，但不告诉你什么渠道。如果按核心算，这个CPU明年在1.5W左右还是能接受的

sss668800 · 发表于 Post on 2025-5-28 16:57:26

llity 发表于 2025-5-28 13:11
好像不需要了，正式版现在3W，正显2w多吧，明年这个时候的价格应该很稳定。

我看淘宝就一家3万的正式版，但是不知道靠不靠谱，其他都是7万以上。

淘宝很多店都是引流的，你得要按实际报价来算

llity · 发表于 Post on 2025-5-28 13:11:02

sss668800 发表于 2025-5-26 09:59
6787P是怎么可能2w的？现在要8w，这个不是大船货，不会大幅度降价的。

大船到岸也是其他型号的，dell ...

好像不需要了，正式版现在3W，正显2w多吧，明年这个时候的价格应该很稳定。

sss668800 · 发表于 Post on 2025-5-26 09:59:08

llity 发表于 2025-5-21 19:23
还没有买，预计9月吧，现在没啥货。看能不能降到2W以内

6787P是怎么可能2w的？现在要8w，这个不是大船货，不会大幅度降价的。

大船到岸也是其他型号的，dell官方肯定没有，甚至能不能用都未必

tonganlhy · 发表于 Post on 2025-5-22 07:50:27

llity 发表于 2025-5-21 21:13
感觉A系列也合适吧

按摩店的话，大多数生信暂时还没有像cuda那样的适配

llity · 发表于 Post on 2025-5-21 21:13:14

tonganlhy 发表于 2025-5-21 19:58
2万以内4090D应该可以。实在不行5080也比上面的选择好很多。

感觉A系列也合适吧

tonganlhy · 发表于 Post on 2025-5-21 19:58:23

llity 发表于 2025-5-21 19:19
显卡只能在2W以内，因为更重要的CPU

2万以内4090D应该可以。实在不行5080也比上面的选择好很多。

llity · 发表于 Post on 2025-5-21 19:23:05

zdb 发表于 2025-5-21 17:58
志强六代你都上了，显卡怎么的也得是个4090 5090吧，至强六代 6900 系列,一颗9000刀呀！

还没有买，预计9月吧，现在没啥货。看能不能降到2W以内

llity · 发表于 Post on 2025-5-21 19:20:37

sobereva 发表于 2025-5-21 05:44
强烈不建议把AI产生的文字直接往论坛里贴，会污染论坛

好的

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