利用SMD隐式溶剂模型计算SN2反应能垒问题

ljc2877437407 · 发表于 Post on 2025-9-10 14:02:07

本帖最后由 ljc2877437407 于 2025-9-10 14:07 编辑

各位老师好，我想请教一下，我用Gaussian算SN2反应的能垒，分别在水(介电常数78.5)、乙腈(介电常数36)、氯仿(介电常数4.7)隐式溶剂模型中，发现水的反应能垒略高于在乙腈中的能垒。正常来讲在水中应该低于乙腈中的能垒。热力学校正通过shermo程序，下面是我计算结果和输入输出文件，恳求各位大佬帮我看看问题出在那里。

ljc2877437407 · 发表于 Post on 2025-9-10 17:28:44

ionexchangeC 发表于 2025-9-10 16:50
只能说该补充有机化学知识了，偶极非质子溶剂相比质子溶剂更有利于SN2反应的进行

但是我感觉还是有点问题，这是隐式溶剂模型，体现不了氢键的作用

ljc2877437407 · 发表于 Post on 2025-9-10 17:19:02

ionexchangeC 发表于 2025-9-10 16:50
只能说该补充有机化学知识了，偶极非质子溶剂相比质子溶剂更有利于SN2反应的进行

好滴，感谢老师

ionexchangeC · 发表于 Post on 2025-9-10 16:50:28

只能说该补充有机化学知识了，偶极非质子溶剂相比质子溶剂更有利于SN2反应的进行

ljc2877437407 · 发表于 Post on 2025-9-10 15:44:22

Daniel_Arndt 发表于 2025-9-10 14:40
如果你的体系中有溴或碘的话，SMD隐式溶剂模型中默认的radii不合适。应该仿照 http://sobereva.com/613 ， ...

谢谢大佬的解答，我已经尝试过了也是这样的

ljc2877437407 · 发表于 Post on 2025-9-10 15:43:46

wzkchem5 发表于 2025-9-10 14:04
这个差别已经在溶剂模型的计算误差范围以内了，不要尝试用它来解释问题

谢谢老师的解答，是不是方法能降低误差呢

Daniel_Arndt · 发表于 Post on 2025-9-10 14:40:05

如果你的体系中有溴或碘的话，SMD隐式溶剂模型中默认的radii不合适。应该仿照 http://sobereva.com/613 ，用SMD18（ https://doi.org/10.1021/jp810292n ）。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2025-9-10 14:04:15

这个差别已经在溶剂模型的计算误差范围以内了，不要尝试用它来解释问题

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