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[GROMACS] 求助:关于TraPPE力场和GAFF力场的兼容性问题

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楼主
请问各位老师,请问TraPPE力场和GAFF力场兼容吗,我想用gromacs模拟有机小分子+超临界二氧化碳的混合体系,我能二氧化碳用TraPPE力场,有机小分子用GAFF力场吗?

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发表于 Post on 2025-9-11 10:38:43 | 只看该作者 Only view this author
我做的不是CO2,用的甲烷,直接定义CO2的力场参数和命名就行了,你可以看看里面的例子

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-11 10:31:36 | 只看该作者 Only view this author
maxuexuehuahua 发表于 2025-9-11 10:17
我之前改过,用的http://sobereva.com/soft/Sobtop/,我觉得可以

二氧化碳的力场直接用TrappE和sobtop产生的小分子的GAFF混用吗?还是需要做什么修改?方便提供下您的二氧化碳力场文件吗,谢谢您!

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发表于 Post on 2025-9-11 10:17:34 | 只看该作者 Only view this author
我之前改过,用的http://sobereva.com/soft/Sobtop/,我觉得可以

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