求助molclus调用高斯对复合物结构优化不收敛

yangna11 · 发表于 Post on 2025-9-16 16:54:10

我的化合物A和化合物B之间存在弱相互作用，且两个化合物都是大分子，原子数加起来为80多个。做复合物（A+B）的结构优化过程中遇到问题
1、首先用genmer随机生成10个团簇
2、molclus调用高斯对其进行结构优化，用isostat进行能量排序
3、优化结果为能量最小的团簇没有收敛、10个化合物中只有1个收敛的，且不是能量最小的（比最小的能量大17kcal/mol）
我的问题是：
1、是否增加genmer 随机生成的团簇构象数量，生成多少较为合适
2、是否可以将能量最小的团簇单独拿出来进行进一步的优化，只计算这个团簇的单点能
3、判断genmer+molclus得到最稳定的一批团簇构象的依据是什么，是否为能量最小的显示结构优化成功
以下是高斯的输入文件以及isostat的排序结果

yangna11 · 发表于 Post on 2025-9-17 08:31:05

好的，谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2025-9-16 23:01:00

先用半经验级别的方法诸如PM6-D3、GFN-xTB预优化，并且了解怎么帮助几何优化收敛，仔细看下文
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

“10个化合物中只有1个收敛的”说明其它9个结构的能量可能根本不靠谱，显然拿当前10个能量作比较毫无意义。
当前情况下增加随机生成的团簇构象数量毫无意义

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