求助：做蛋白-小分子复合物模拟前，Gaussian优化小分子时的关键词选择

crush · 发表于 Post on 2025-10-29 10:04:59

我在做蛋白-小分子复合物在水中的动力学模拟，在做小分子拓扑时，想先使用Gaussian对小分子结构进行优化，然后交给Multiwfn计算RESP电荷，最后使用sobtop做小分子的拓扑。

本人是量子化学方面的新手，所以想请教一下各位老师：
1.我这个小分子的Gaussian的关键词是否合理？
2.sob老师推荐以溶剂环境下的非可极化力场的分子动力学模拟为目的，RESP2(0.5)电荷更合适。如果cpu资源紧张，想快速计算RESP电荷的话，仅计算隐式溶剂模型下的RESP电荷跑MD是否也能接受？
在此之前已经参考过sob老师的两篇教程 1. http://sobereva.com/441 2. http://sobereva.com/531

crush · 发表于 Post on 2025-10-30 09:37:33

sobereva 发表于 2025-10-30 08:51
1 合理
2 可以。但根本省不了多少时间

好的，谢谢sob老师

sobereva · 发表于 Post on 2025-10-30 08:51:46

1 合理
2 可以。但根本省不了多少时间

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