cif文件可以从VESTA里打开，不可以从Materials Studio里和OVITO里打开

xtzAwesome · 发表于 Post on 2025-12-3 10:53:56

各位老师们好ᕑᗢᓫ，我从springer materials数据库获取了cif文件之后（此cif文件中有Standardized和Published两套数据，两套数据的晶胞形状不同，但是原子间的距离、连接方式、配位环境等是一致的），在VESTA软件中可以打开并看到正确的结构，但是在Materials Studio里和OVITO里都打不开。在Materials Studio里的项目日志中写的是：No crystal system (cell setting) present in data block sm_isp_SD1520662（数据块 sm_isp_SD1520662 中未检测到晶体系统晶格结构）和 Error in processing loop for atom data（处理原子数据循环时出错）；在OVITO里的报错里写的是CIF file reader: single data block expected, got 4（CIF文件读取器：预期单个数据块，实际收到4个）

我用记事本打开cif文件可以看到很多问号，并且此文件是2001年的比较早，不知道和这些有没有关系。

后来我在VESTA中打开CIF文件，并Export Data为CIF格式，导入Materials Studio成功，但是项目日志中出现No crystal system (cell setting) present in data block VESTA_phase_1（数据块VESTA_phase_1中未检测到晶体系统晶胞设置）和 Data block VESTA_phase_1 does not contain any connectivity information（数据块 VESTA_phase_1 不包含任何连接信息）

希望可以有老师帮助我一下下૮⑉･-･⑉ა 非常感谢！！！

xtzAwesome · 发表于 Post on 2025-12-8 14:14:23

yuzc 发表于 2025-12-7 15:28
您能顺利读取结构就很好了，那这个问题可以关闭了。另外事实上您第二句话其实不太严谨，cif是完全支持成 ...

知道啦知道啦，感谢yu老师的补充！！！！！! 'ᜊ'

yuzc · 发表于 Post on 2025-12-7 15:28:21

xtzAwesome 发表于 2025-12-4 15:53
谢谢老师！我没太明白老师的意思……期待老师的讲解！我的后续是：我已经在cif文件中增加_space_group_cr ...

您能顺利读取结构就很好了，那这个问题可以关闭了。另外事实上您第二句话其实不太严谨，cif是完全支持成键信息描述的，分为单，双，芳香三种情况。只不过大多数软件不会读取这个_loop下的关键词罢了。

xtzAwesome · 发表于 Post on 2025-12-4 15:53:41

yuzc 发表于 2025-12-3 16:14
和cif文件中的关键词出现位置与写法有关。实际上cif的标准写法里，有大量的关键词去体现晶体信息，只是常用 ...

谢谢老师！我没太明白老师的意思……期待老师的讲解！我的后续是：我已经在cif文件中增加_space_group_crystal_system 'monoclinic'晶体结构信息，在Materials Studio中打开不提示No crystal system (cell setting) present in data block 了，现在只提示缺少连接方式。后来我知道本来cif文件里就是没有连接方式的，而VESTA软件它可以默认自动计算键，所以我手动计算键就可以了应该。非常感谢yu老师的帮助！

xtzAwesome · 发表于 Post on 2025-12-4 15:08:12

sobereva 发表于 2025-12-4 12:43
认真看置顶的社员必读贴了解怎么正确贴图

好的sob老师 ៷>ᴗ<៷！

sobereva · 发表于 Post on 2025-12-4 12:43:24

xtzAwesome 发表于 2025-12-3 16:37
谢谢老师！我没太明白老师的意思……就是，您看'▾'，在VESTA中的结构是全面的，而在MS中就是丢失晶 ...

认真看置顶的社员必读贴了解怎么正确贴图

xtzAwesome · 发表于 Post on 2025-12-3 16:37:06

yuzc 发表于 2025-12-3 16:14
和cif文件中的关键词出现位置与写法有关。实际上cif的标准写法里，有大量的关键词去体现晶体信息，只是常用 ...

谢谢老师！我没太明白老师的意思……就是，您看'▾'，在VESTA中的结构是全面的，而在MS中就是丢失晶胞设置和连接信息的C:\Users\Windows 10\Desktop\微信图片_2025-12-03_163341_198.pngC:\Users\Windows 10\Desktop\微信图片_2025-12-03_163510_075.pngC:\Users\Windows 10\Desktop\微信图片_2025-12-03_103059_229.png

yuzc · 发表于 Post on 2025-12-3 16:14:49

和cif文件中的关键词出现位置与写法有关。实际上cif的标准写法里，有大量的关键词去体现晶体信息，只是常用的关键词就那么几个。如果你只关心原子位置和空间群的话，来回倒几下就行了。

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