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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › 求助粗粒度金纳米颗粒能量最小化跑乱的问题
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[粗粒化/DPD] 求助粗粒度金纳米颗粒能量最小化跑乱的问题

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gaochangcheng

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楼主
发表于 Post on 2025-12-8 11:01:30 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式 Reading model
各位老师，我根据文献HIV-1 TAT肽及其共轭金纳米颗粒跨脂膜转位的分子机制——物理化学化学物理（RSC出版社），自己写了一个程序，构建了一个与该文献类似的2纳米的金纳米颗粒（AU 788.0 0.000 A 0.408 3.7），但是跑完能量最小化后金纳米颗粒都跑乱了，是为什么呢，请问是力场问题吗，有没有合适的脚本构建粗粒度金纳米颗粒的结构和力场呀


202512081058111765..png (67.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

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AuNP_cuboctahedral.gro

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AuNP_cuboctahedral.itp

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minim.mdp

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