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[新手求助] 3-硝基茶酚分子内氢转移生成HONO的过渡态优化报错求助

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本帖最后由 jiangjs848 于 2025-12-17 09:51 编辑

各位老师好,我目前在优化3-硝基茶酚分子内氢转移生成HONO的过渡态,我设置的过渡态初猜是[color=rgba(0, 0, 0, 0.9)]OH的H与硝基O键长为1.20Å,O(羟基氧)–H–O(硝基氧)为165°, C-O(羟基氧)–H–O(硝基氧)为8°的初猜结构进行过渡态优化,没成功优化,输入文件和输出文件在下方压缩包中,还请各位老师不吝赐教!


40aa3fac1eac408071147061059b4b4.png (81.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

40aa3fac1eac408071147061059b4b4.png

1f13cf286bf0a26df1be301ae3bd3ae.png (67.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

1f13cf286bf0a26df1be301ae3bd3ae.png

氢转移后.png (34.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

氢转移后.png

2.png (49.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

2.png

氢转移前.png (34.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

氢转移前.png

H13O15.zip

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发表于 Post on 2025-12-17 16:42:13 | 只看该作者 Only view this author
jiangjs848 发表于 2025-12-17 11:16
感谢老师指点,因为那一篇文献中的基态S0氢转移存在过渡态,所以我也尝试着寻找这个分子基态S0的过渡态, ...

如果一直找不到过渡态,可以试试柔性扫描,如果柔性扫描步长足够小、范围足够宽,且能量变化是单调的,那么说明不存在过渡态。
不是所有反应都存在过渡态,而且一个有过渡态的反应(假如正反应能垒很低或逆反应能垒很低)即使做很小的扰动也可能会变成一个没有过渡态的反应,这里很小的扰动包括但不限于理论级别、溶剂、取代基、抗衡离子等。所以文献有过渡态未必意味着你也应该有过渡态,如果找过渡态总是失败,应当考虑不存在过渡态的可能性
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-17 11:16:33 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-12-17 10:08
基态可以算一下,但算出来不管什么结果也无需感到奇怪(例如没有过渡态,有过渡态但产物不对,等等)。T1 ...

感谢老师指点,因为那一篇文献中的基态S0氢转移存在过渡态,所以我也尝试着寻找这个分子基态S0的过渡态,试过很多次过渡态初猜但没有成功,老师可否给一点这个分子氢转移过渡态初猜的建议

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发表于 Post on 2025-12-17 10:08:33 | 只看该作者 Only view this author
jiangjs848 发表于 2025-12-17 10:05
是的老师,这是一个光解反应,目前有论文在研究硝基苯酚的分子,相关文献中有关于对基态S0和三重态T1的势 ...

基态可以算一下,但算出来不管什么结果也无需感到奇怪(例如没有过渡态,有过渡态但产物不对,等等)。T1势能面上有过渡态,不代表S0势能面上也有
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-17 10:05:41 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-12-17 09:58
这个反应需要光才能进行吧?如果需要光,不能当作基态反应来算,最起码也要算一下S1、T1态,严格的处理要用 ...

是的老师,这是一个光解反应,目前有论文在研究硝基苯酚的分子,相关文献中有关于对基态S0和三重态T1的势能面的计算,所以我就想着先计算这个分子S0的势能面(难道是基态没有氢转移的过渡态吗)

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发表于 Post on 2025-12-17 09:58:57 | 只看该作者 Only view this author
这个反应需要光才能进行吧?如果需要光,不能当作基态反应来算,最起码也要算一下S1、T1态,严格的处理要用非绝热动力学
Zikuan Wang
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-17 09:53:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-17 02:26
1.png和2.png相同,根本没法看出怎么转移
先给出转移前后的无虚频的极小点结构,别人才能判断过渡态初猜 ...

sob老师,我已将转移前后无虚频的稳定结构上传,中间的图片是我过渡态的初猜,劳烦您看一下

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发表于 Post on 2025-12-17 02:26:42 | 只看该作者 Only view this author
jiangjs848 发表于 2025-12-16 10:05
好的,sob老师,我已经在上面加上了过渡态的初猜结构了

1.png和2.png相同,根本没法看出怎么转移
先给出转移前后的无虚频的极小点结构,别人才能判断过渡态初猜应该什么样才合适
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-16 10:05:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-16 00:23
把转移前后的极小点结构贴出来

好的,sob老师,我已经在上面加上了过渡态的初猜结构了

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发表于 Post on 2025-12-16 00:23:15 | 只看该作者 Only view this author
把转移前后的极小点结构贴出来
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