求助斯托克斯位移和S0态S1态RMSD关系

ysuzpzp · 发表于 Post on 2026-1-13 22:16:18

各位老师好：我看到一篇文献说到关于斯托克斯位移测量了由于非辐射弛豫而造成的能量损失，用S0态和S1态下的几何结构RMSD来衡量，表现出一定的正相关关系。但是还有几个异常点，RMSD和斯托克斯位移不是很好的正相关。请问一下这种异常情况出现的原因是什么，或者说是不是S0和S1的结构间RMSD本身就和斯托克斯位移不是直接的关联

ysuzpzp · 发表于 Post on 2026-1-15 16:55:05

ffcc 发表于 2026-1-14 14:10
请问是那篇文献可以发出来学习一下吗？谢谢

doi: 10.1063/5.0214967

ysuzpzp · 发表于 Post on 2026-1-15 16:54:34

wal 发表于 2026-1-13 22:27
感觉RMSD只是几何差异的一个粗指标，和能量耗散之间也很难保证强相关。势能面平缓的情况下有可能几何变化不 ...

感谢您的解答，我明白了。对于文献中用RMSD衡量斯托克斯位移，我觉得是因为他研究了一系列结构，他想要去建立一个RMSD和斯托克斯位移之间的一个定性趋势

ffcc · 发表于 Post on 2026-1-14 14:10:47

请问是那篇文献可以发出来学习一下吗？谢谢

wal · 发表于 Post on 2026-1-13 22:27:54

本帖最后由 wal 于 2026-1-13 22:33 编辑

感觉RMSD只是几何差异的一个粗指标，和能量耗散之间也很难保证强相关。势能面平缓的情况下有可能几何变化不小但是能量实际上没变多少
另外stokes shift还有外重组能的事，比如溶剂弛豫，而RMSD应该只跟内重组能相关

而且怎么感觉用RMSD衡量stokes shift是一种迷惑行为，你结构都优化出来了，不按定义直接算个能量差，要去求什么RMSD。。

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[综合交流] 求助斯托克斯位移和S0态S1态RMSD关系

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